More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0896 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 190 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  59.63 
 
 		 194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  49.71 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  49.43 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  56.72 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  55.97 
 
 		 221 aa  154  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  46.2 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  50.37 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  50.37 
 
 		 251 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  48.89 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  48.89 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  50.37 
 
 		 194 aa  137  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  48.15 
 
 		 245 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  49.63 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  44.32 
 
 		 218 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  48.15 
 
 		 206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  49.25 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  49.25 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  42.7 
 
 		 226 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  49.25 
 
 		 219 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  47.76 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  47.18 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  48.51 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  44.83 
 
 		 208 aa  95.5  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  47.79 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  41.58 
 
 		 603 aa  71.2  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  35.43 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  40.43 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  45 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  46.25 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  46.25 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  45 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  45 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  45 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  46.25 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  39.58 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  41.84 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  40.82 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  33.93 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  45 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  37.37 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  45 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  39.18 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  42.5 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  25 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  38.26 
 
 		 299 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  34.51 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  38.95 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  40.91 
 
 		 260 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  35.14 
 
 		 262 aa  64.3  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.63 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  41.46 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  40.43 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  42.35 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  37.63 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.9 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  34.19 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  36.45 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  36.15 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  43.33 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  37.65 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  41.11 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  44.87 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  31.17 
 
 		 280 aa  62  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  38.64 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  36.27 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  34.29 
 
 		 325 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  45.57 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  37.86 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  37.23 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  36.17 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  36.84 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  36.73 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2296  Lytic transglycosylase catalytic  34.92 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000211124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  42.2 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0483  lytic transglycosylase, catalytic  38.38 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  39.1 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  39.6 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  39.39 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  38.82 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  38.3 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  34.86 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  32.72 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0187  lytic transglycosylase, catalytic  37.39 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0753643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  37.11 
 
 		 362 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  35.79 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  35.78 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  40.74 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  33 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>