265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1940 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 593 aa  1224    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  66.72 
 
 		 595 aa  811    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  55.63 
 
 		 623 aa  657    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  64.35 
 
 		 640 aa  787    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  47.91 
 
 		 627 aa  554  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  42.95 
 
 		 710 aa  482  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  40.88 
 
 		 590 aa  477  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  44.43 
 
 		 604 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  37.12 
 
 		 645 aa  378  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.6 
 
 		 614 aa  322  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.19 
 
 		 621 aa  316  8e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  35.61 
 
 		 614 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.44 
 
 		 651 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 		 603 aa  302  9e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.87 
 
 		 620 aa  280  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.96 
 
 		 884 aa  280  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.17 
 
 		 799 aa  273  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.37 
 
 		 905 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.4 
 
 		 614 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.84 
 
 		 575 aa  269  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.39 
 
 		 757 aa  266  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.65 
 
 		 614 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.67 
 
 		 609 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.33 
 
 		 901 aa  256  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  34.02 
 
 		 864 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.56 
 
 		 800 aa  253  8.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.34 
 
 		 932 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  30.81 
 
 		 600 aa  252  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.07 
 
 		 623 aa  250  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.17 
 
 		 602 aa  250  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.61 
 
 		 892 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  29.45 
 
 		 626 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.77 
 
 		 640 aa  239  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  32.47 
 
 		 980 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.76 
 
 		 619 aa  226  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.81 
 
 		 1064 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  32.05 
 
 		 889 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  31.35 
 
 		 584 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  30.27 
 
 		 613 aa  201  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 945 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.34 
 
 		 923 aa  188  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.82 
 
 		 619 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.22 
 
 		 743 aa  128  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  26.22 
 
 		 600 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  25.37 
 
 		 815 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  25.81 
 
 		 607 aa  112  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  25.77 
 
 		 750 aa  110  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  23.7 
 
 		 598 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  24.72 
 
 		 862 aa  109  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  25.98 
 
 		 591 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  24.09 
 
 		 590 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  24.61 
 
 		 928 aa  102  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.74 
 
 		 1424 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.57 
 
 		 837 aa  98.6  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.9 
 
 		 811 aa  98.2  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  24.27 
 
 		 598 aa  97.1  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  26.1 
 
 		 603 aa  95.9  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  25 
 
 		 804 aa  95.9  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 		 803 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  25.98 
 
 		 1024 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  25 
 
 		 1063 aa  95.1  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  23.98 
 
 		 827 aa  95.5  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  22.28 
 
 		 925 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  25.31 
 
 		 1050 aa  94  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.6 
 
 		 986 aa  94  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  25.31 
 
 		 1066 aa  94  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  25.31 
 
 		 1066 aa  94  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  24.73 
 
 		 1029 aa  94  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  24.72 
 
 		 804 aa  93.2  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.99 
 
 		 598 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.46 
 
 		 805 aa  92.8  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  25.25 
 
 		 670 aa  91.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  23.41 
 
 		 1015 aa  90.9  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  27.49 
 
 		 972 aa  90.9  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  23.42 
 
 		 686 aa  90.5  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  25.4 
 
 		 1036 aa  90.5  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  26.33 
 
 		 596 aa  90.5  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  22.89 
 
 		 644 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  25.56 
 
 		 568 aa  89  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  23.68 
 
 		 785 aa  89  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  24.84 
 
 		 1044 aa  88.6  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.85 
 
 		 1033 aa  87.8  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  21.52 
 
 		 601 aa  87.4  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.27 
 
 		 858 aa  87  9e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  24.76 
 
 		 891 aa  86.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.64 
 
 		 805 aa  87  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  22.44 
 
 		 824 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.12 
 
 		 808 aa  86.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  22.91 
 
 		 603 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  22.7 
 
 		 603 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.15 
 
 		 787 aa  85.9  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  27.55 
 
 		 1032 aa  85.9  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  22.74 
 
 		 1045 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.18 
 
 		 824 aa  85.5  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  22.7 
 
 		 603 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 		 932 aa  85.9  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  22.7 
 
 		 603 aa  85.5  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  23.48 
 
 		 577 aa  84.7  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.8 
 
 		 794 aa  84.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  22.48 
 
 		 603 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>