197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5424 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 309 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  50.96 
 
 		 306 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  46.46 
 
 		 306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  43.37 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  46.28 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  47.25 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  46.65 
 
 		 308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  43.09 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  42.17 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  41.72 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  42.58 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  46.95 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  43.71 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  48.87 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  37.78 
 
 		 314 aa  187  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  42.07 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  36.73 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  39.26 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  39.06 
 
 		 279 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  38.73 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  39.12 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  32.13 
 
 		 347 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  31.23 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  30.03 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  32.09 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  30.16 
 
 		 319 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  29.33 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  29.47 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  29.12 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  29.35 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  32.53 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  31.19 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  31.99 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  31.99 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  27.54 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  28.04 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  28.2 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  29.63 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  29.49 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  29.33 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  31.38 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  29.57 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  30.14 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  26.39 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  26.1 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.94 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  28.09 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  28.71 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  31.08 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  28.43 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  27.57 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  35.15 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  29.69 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  26.62 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  31.05 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  31.4 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  25.43 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  27.8 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  27.78 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  29.29 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  29.93 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  28.92 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  26.84 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  27.56 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  27.61 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  28.09 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0694  auxin efflux carrier  29.09 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  25.61 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  25.34 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  26.55 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  24.72 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  29.6 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  28.1 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  24.75 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  30.15 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  26.76 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  28.26 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  28.26 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  26.91 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  25.97 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.26 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  29.19 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  28.72 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  29.43 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  27.69 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  26.64 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  27.7 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  26.23 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  27.12 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  29.62 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  23.99 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  27.84 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  24.35 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  25.65 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  29.13 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>