125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3774 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 583 aa  1153    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  62.75 
 
 		 598 aa  667    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  62.54 
 
 		 594 aa  654    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  48.8 
 
 		 593 aa  480  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  48.71 
 
 		 621 aa  475  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  48.03 
 
 		 601 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  48.28 
 
 		 591 aa  475  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  48.79 
 
 		 593 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  47.54 
 
 		 606 aa  470  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  47.51 
 
 		 595 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  46.72 
 
 		 589 aa  466  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  48.64 
 
 		 622 aa  465  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  46.55 
 
 		 593 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  47.64 
 
 		 563 aa  461  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  48.08 
 
 		 565 aa  458  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  45.75 
 
 		 606 aa  455  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  47.41 
 
 		 598 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  47.47 
 
 		 566 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  46.26 
 
 		 626 aa  452  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  45.3 
 
 		 574 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  46.21 
 
 		 569 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  45.21 
 
 		 582 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  48.01 
 
 		 628 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  46.86 
 
 		 574 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  45.86 
 
 		 592 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  45.53 
 
 		 599 aa  445  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  45.42 
 
 		 560 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  45.42 
 
 		 560 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  45.42 
 
 		 560 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  45.67 
 
 		 572 aa  442  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  45.73 
 
 		 618 aa  438  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  47.87 
 
 		 601 aa  428  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  47.13 
 
 		 586 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  46.46 
 
 		 577 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  47.15 
 
 		 575 aa  415  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  36.1 
 
 		 559 aa  286  5.999999999999999e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  27.44 
 
 		 477 aa  140  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  28.17 
 
 		 472 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  28.17 
 
 		 472 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  28.03 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  28.18 
 
 		 471 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  26.85 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  26.85 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  26.62 
 
 		 469 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  26.2 
 
 		 434 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  28.5 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  27.18 
 
 		 464 aa  115  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  25.82 
 
 		 466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  26.29 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  29.07 
 
 		 465 aa  111  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  26.23 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  29.06 
 
 		 456 aa  101  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  30.45 
 
 		 429 aa  101  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  28.54 
 
 		 466 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  29.04 
 
 		 435 aa  95.9  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  25.37 
 
 		 470 aa  95.5  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  29.4 
 
 		 601 aa  90.9  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  29.01 
 
 		 608 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  27.27 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  30.05 
 
 		 622 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1131 aa  72  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1034  type III restriction protein res subunit  25.37 
 
 		 1126 aa  71.2  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  22.41 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  25.06 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  24.6 
 
 		 489 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 1137 aa  66.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  24.04 
 
 		 787 aa  63.9  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  21.2 
 
 		 698 aa  62.4  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  23.12 
 
 		 1137 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4712  type III restriction enzyme, res subunit  22.76 
 
 		 1137 aa  61.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4808  type III restriction enzyme, res subunit  22.76 
 
 		 1137 aa  60.8  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.564367  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2984  type III restriction protein res subunit  26.82 
 
 		 1113 aa  60.8  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135376  normal  0.189592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  24.29 
 
 		 995 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  29.37 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  21.87 
 
 		 707 aa  58.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  22.62 
 
 		 949 aa  54.3  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5781  type III restriction protein res subunit  23.42 
 
 		 978 aa  54.3  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3004  type III restriction protein res subunit  23.48 
 
 		 1129 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385036  normal  0.0400425 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  24.22 
 
 		 706 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  23.65 
 
 		 791 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  24.21 
 
 		 493 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1144 aa  51.2  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3974  type III restriction enzyme, res subunit  23.8 
 
 		 1093 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361688  normal  0.0160055 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02066  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  24.63 
 
 		 1157 aa  51.2  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3202  type III restriction protein res subunit  21.25 
 
 		 1133 aa  50.8  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  30.59 
 
 		 1129 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  22.18 
 
 		 800 aa  50.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1523  DEAD/DEAH box helicase-like  23.35 
 
 		 936 aa  50.4  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  26.69 
 
 		 835 aa  50.4  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  26.39 
 
 		 440 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  20.31 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  24.75 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  26.67 
 
 		 1167 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  24.03 
 
 		 932 aa  47.4  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  25.45 
 
 		 444 aa  47.4  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  20.94 
 
 		 899 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  25.98 
 
 		 499 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  24.03 
 
 		 932 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2408  type III restriction enzyme, res subunit  22.82 
 
 		 907 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  26.47 
 
 		 953 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>