More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3695 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3695  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 162 aa  315  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171458  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  65.13 
 
 		 189 aa  197  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  59.73 
 
 		 168 aa  173  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  47.37 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 169 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 169 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 169 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  43.67 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 178 aa  123  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  40 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 		 166 aa  98.2  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  40.82 
 
 		 176 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  39.39 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 352 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  35.38 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  40.62 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  37.5 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  28.69 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  27.27 
 
 		 283 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  30 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 313 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  38.39 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 208 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 141 aa  51.6  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 170 aa  51.2  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 185 aa  50.8  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  28 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 177 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  35.82 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  50.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  33.01 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  38.16 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  32.98 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  32.98 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 340 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 326 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 340 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  35.79 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1940  regulatory protein MarR  38.37 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  35.21 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>