221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2384 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  100 
 
 		 1099 aa  2068    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  43.4 
 
 		 1103 aa  313  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  51.18 
 
 		 824 aa  212  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  41.62 
 
 		 815 aa  204  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  48.91 
 
 		 824 aa  202  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  41.73 
 
 		 810 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  44.56 
 
 		 910 aa  135  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  41.05 
 
 		 906 aa  125  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  29.11 
 
 		 1114 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  32.02 
 
 		 961 aa  118  6.9999999999999995e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  33.51 
 
 		 1172 aa  112  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  35.15 
 
 		 1018 aa  112  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  32.99 
 
 		 1172 aa  111  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  33.05 
 
 		 1116 aa  111  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  35.03 
 
 		 1030 aa  109  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  44.12 
 
 		 1009 aa  109  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  38.12 
 
 		 1081 aa  109  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  44 
 
 		 1165 aa  108  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  42.86 
 
 		 1009 aa  107  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  42.86 
 
 		 1009 aa  107  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  34.98 
 
 		 1291 aa  107  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  39.19 
 
 		 1020 aa  105  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  49.53 
 
 		 1219 aa  105  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  19.76 
 
 		 1108 aa  103  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  37.34 
 
 		 953 aa  103  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  42.46 
 
 		 1137 aa  102  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  37.57 
 
 		 1091 aa  103  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  31.94 
 
 		 1180 aa  102  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  44.67 
 
 		 881 aa  102  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  37.5 
 
 		 1226 aa  102  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  49.52 
 
 		 1346 aa  102  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  37.57 
 
 		 1211 aa  102  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  35.64 
 
 		 995 aa  102  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  32.68 
 
 		 1303 aa  102  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  33.33 
 
 		 904 aa  102  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  32.26 
 
 		 851 aa  101  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  40.94 
 
 		 1227 aa  101  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  31.68 
 
 		 1307 aa  100  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  23.83 
 
 		 1029 aa  100  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  37.58 
 
 		 1038 aa  100  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  35.08 
 
 		 1006 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  33.91 
 
 		 1091 aa  99.8  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  40.56 
 
 		 1227 aa  99.4  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  41.76 
 
 		 989 aa  99.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  39.01 
 
 		 1214 aa  99  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  35.32 
 
 		 1020 aa  99.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  40.41 
 
 		 1085 aa  97.8  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  23.83 
 
 		 1029 aa  97.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  38.25 
 
 		 1265 aa  97.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  32.46 
 
 		 1059 aa  97.4  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  38.83 
 
 		 1230 aa  97.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  39.44 
 
 		 1229 aa  97.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  36.62 
 
 		 1018 aa  97.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  36.62 
 
 		 1018 aa  97.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  36.62 
 
 		 1018 aa  97.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  36.62 
 
 		 1018 aa  96.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  36.62 
 
 		 1018 aa  97.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  39.44 
 
 		 1229 aa  97.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  39.44 
 
 		 1220 aa  97.1  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  36.61 
 
 		 1226 aa  96.3  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  46.02 
 
 		 1214 aa  96.3  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  39.04 
 
 		 1088 aa  96.3  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  47.22 
 
 		 1164 aa  96.3  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  39.16 
 
 		 1214 aa  95.9  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  38.24 
 
 		 1227 aa  95.9  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  38.81 
 
 		 1227 aa  95.9  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  39.04 
 
 		 1234 aa  95.9  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  32.32 
 
 		 1018 aa  95.1  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  36.62 
 
 		 1018 aa  95.1  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  39.44 
 
 		 1144 aa  94.7  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  36.62 
 
 		 1018 aa  94.7  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  36.62 
 
 		 1018 aa  94.7  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  37.65 
 
 		 1214 aa  94  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  22.33 
 
 		 1011 aa  94  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  31.94 
 
 		 1023 aa  94.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  35.26 
 
 		 1223 aa  94  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 1018 aa  94.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  29.59 
 
 		 1029 aa  94  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  32.69 
 
 		 1018 aa  94.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  33.5 
 
 		 1025 aa  93.6  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  38.62 
 
 		 1223 aa  94  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  31.05 
 
 		 1013 aa  93.2  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  37.65 
 
 		 1214 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  37.78 
 
 		 1083 aa  93.6  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  37.65 
 
 		 1214 aa  93.2  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  30.23 
 
 		 1017 aa  92.8  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  31.31 
 
 		 1019 aa  92.8  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  35.71 
 
 		 962 aa  92.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  37.5 
 
 		 1224 aa  92.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  20.19 
 
 		 1039 aa  92.8  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  38.1 
 
 		 1022 aa  92  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  48 
 
 		 1223 aa  92  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  32.69 
 
 		 1018 aa  92  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  38.22 
 
 		 1029 aa  91.7  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  35.78 
 
 		 986 aa  91.3  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  40.41 
 
 		 1238 aa  90.9  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  30.61 
 
 		 1029 aa  90.1  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  26.67 
 
 		 1029 aa  90.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  42.47 
 
 		 1047 aa  90.1  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  42.47 
 
 		 1047 aa  90.1  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>