219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0834 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  100 
 
 		 1202 aa  2425    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  31.87 
 
 		 728 aa  310  9e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  38.31 
 
 		 448 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  35.61 
 
 		 713 aa  183  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  33.24 
 
 		 560 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  24.58 
 
 		 938 aa  181  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  32.96 
 
 		 1001 aa  172  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  24.53 
 
 		 815 aa  168  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  34.64 
 
 		 675 aa  163  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  32.75 
 
 		 669 aa  160  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  32.79 
 
 		 1042 aa  155  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  30.75 
 
 		 581 aa  148  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  33.44 
 
 		 960 aa  148  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  29.9 
 
 		 769 aa  146  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  28.9 
 
 		 1279 aa  138  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  30.75 
 
 		 1361 aa  136  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  30.53 
 
 		 658 aa  135  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  30.41 
 
 		 403 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  32.6 
 
 		 374 aa  128  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  45.52 
 
 		 171 aa  128  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  30.36 
 
 		 379 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  30.51 
 
 		 996 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  26.8 
 
 		 685 aa  111  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  26.06 
 
 		 971 aa  109  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  29.44 
 
 		 679 aa  107  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  25.45 
 
 		 819 aa  101  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0492  hypothetical protein  32.2 
 
 		 195 aa  97.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.652654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3268  hypothetical protein  25.42 
 
 		 329 aa  89.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0855187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  25.75 
 
 		 514 aa  89  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3727  hypothetical protein  29.06 
 
 		 331 aa  88.6  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0495  hypothetical protein  40 
 
 		 126 aa  88.2  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1859  hypothetical protein  26.26 
 
 		 529 aa  79.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.956553 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  27.57 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  32.61 
 
 		 169 aa  71.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  33.85 
 
 		 160 aa  68.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  33.85 
 
 		 160 aa  68.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0522  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  33.07 
 
 		 172 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0057  WD40 domain-containing protein  32.31 
 
 		 175 aa  67.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.21 
 
 		 407 aa  67  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0278  WD40 domain-containing protein  26.32 
 
 		 463 aa  67  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605867  unclonable  0.0000100324 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  42.47 
 
 		 517 aa  67.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  28.16 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  26.99 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  23.59 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  24.51 
 
 		 572 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  24.43 
 
 		 428 aa  64.3  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  24.32 
 
 		 461 aa  64.3  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3324  hypothetical protein  23.99 
 
 		 324 aa  63.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0125921  normal  0.0119157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  27.8 
 
 		 771 aa  64.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  26.34 
 
 		 567 aa  63.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.4 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  27.75 
 
 		 423 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  27 
 
 		 423 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  23.47 
 
 		 444 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  27 
 
 		 433 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  23.23 
 
 		 1059 aa  60.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1181  hypothetical protein  28.39 
 
 		 442 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.726983  normal  0.0574597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  27 
 
 		 423 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  28 
 
 		 445 aa  60.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  23.47 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  23.47 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  27.75 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  23.21 
 
 		 441 aa  57.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  23.12 
 
 		 441 aa  57.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25 
 
 		 442 aa  57  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  24.88 
 
 		 426 aa  57  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  24 
 
 		 435 aa  57  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  22.78 
 
 		 450 aa  57  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2360  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  22.37 
 
 		 446 aa  56.2  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.28939 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  23.57 
 
 		 442 aa  56.2  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  23.35 
 
 		 454 aa  56.2  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  24.5 
 
 		 451 aa  56.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.44 
 
 		 446 aa  56.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  30.38 
 
 		 439 aa  56.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.87 
 
 		 442 aa  55.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2850  hypothetical protein  28.33 
 
 		 363 aa  55.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.643098  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  21.54 
 
 		 438 aa  55.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3979  hypothetical protein  29.51 
 
 		 171 aa  55.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  26.18 
 
 		 414 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  21.38 
 
 		 440 aa  55.5  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4021  WD40 domain protein beta Propeller  29.51 
 
 		 171 aa  55.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  32.86 
 
 		 197 aa  55.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  32.86 
 
 		 197 aa  55.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  24.1 
 
 		 420 aa  54.3  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  24.03 
 
 		 442 aa  54.3  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  25.99 
 
 		 450 aa  54.3  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  23.26 
 
 		 442 aa  54.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  26.35 
 
 		 444 aa  54.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  25.42 
 
 		 437 aa  53.5  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  21.52 
 
 		 450 aa  53.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  24.88 
 
 		 432 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  22.15 
 
 		 449 aa  53.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  22.15 
 
 		 449 aa  53.5  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  25.36 
 
 		 439 aa  53.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  28.25 
 
 		 438 aa  53.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  25.71 
 
 		 432 aa  53.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  23.53 
 
 		 442 aa  53.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  25.91 
 
 		 433 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  25.91 
 
 		 433 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  24.42 
 
 		 432 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>