More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0325 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 442 aa  904    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.57 
 
 		 419 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.44 
 
 		 419 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.44 
 
 		 419 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0954  peptidase dimerisation domain protein  34.13 
 
 		 426 aa  166  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.26 
 
 		 395 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.54 
 
 		 398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.74 
 
 		 399 aa  160  5e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  29.48 
 
 		 413 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  30.62 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.09 
 
 		 435 aa  153  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.37 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.34 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.4 
 
 		 409 aa  151  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.09 
 
 		 409 aa  149  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  29.36 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.37 
 
 		 410 aa  147  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.81 
 
 		 431 aa  147  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3712  putative acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase and related deacylases  29.32 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.78 
 
 		 423 aa  143  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.5 
 
 		 423 aa  143  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.81 
 
 		 411 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1035  peptidase dimerisation domain protein  29.09 
 
 		 424 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.07 
 
 		 407 aa  140  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.42 
 
 		 433 aa  139  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1114  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.85 
 
 		 429 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3273  hypothetical protein  30.51 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425351  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.88 
 
 		 410 aa  137  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.67 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  30.64 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3470  peptidase M20  32.55 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3277  peptidase M20:peptidase dimerisation  31.21 
 
 		 422 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3143  peptidase M20  32.26 
 
 		 424 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.138788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.81 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  30.82 
 
 		 414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.91 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.48 
 
 		 439 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.25 
 
 		 423 aa  126  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  29.29 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.97 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  28.57 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  30.94 
 
 		 394 aa  124  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  28.28 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.98 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1823  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.05 
 
 		 369 aa  121  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.248504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  27.25 
 
 		 396 aa  120  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25.45 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  29.97 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.1 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.1 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1610  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.27 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  29.97 
 
 		 388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.53 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1982  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.18 
 
 		 376 aa  111  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  25.28 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25.28 
 
 		 422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  28.33 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  29.48 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  29.82 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  29.82 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  26.95 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  26.2 
 
 		 422 aa  106  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.46 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.61 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4431  peptidase dimerisation domain protein  27.74 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0204618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  29.29 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4825  acetylornithine deacetylase  25.58 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0895557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  26.29 
 
 		 385 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  29.3 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0406  acetylornithine deacetylase  25.4 
 
 		 424 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  28.26 
 
 		 385 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0497  acetylornithine deacetylase  25.87 
 
 		 424 aa  103  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00375868  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27 
 
 		 383 aa  103  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0548  acetylornithine deacetylase  25.41 
 
 		 424 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000707223  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3865  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.9 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.838236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.29 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3149  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.75 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0548  acetylornithine deacetylase  25.4 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166552  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  28.96 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.59 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  26.85 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.16 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0475  acetylornithine deacetylase  25.4 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  29.06 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.18 
 
 		 383 aa  102  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  28.19 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  30.32 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.86 
 
 		 376 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  26.59 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  29.22 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  24.51 
 
 		 407 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1198  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.19 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.19 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2751  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.19 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2602  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.19 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02325  hypothetical protein  27.19 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1205  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.19 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.270871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  25.88 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2618  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.19 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0046  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.16 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>