More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2236 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  77.6 
 
 		 198 aa  297  7e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1307  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  34.07 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  42.53 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3340  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  28.12 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  21.92 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
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NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 497 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  22.01 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5330  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
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NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
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NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  26.7 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
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NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
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NC_010001  Cphy_1910  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0010144  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
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