More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3700 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3700  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  286  6e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  60.71 
 
 		 140 aa  187  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  58.87 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  51.43 
 
 		 140 aa  158  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  50.71 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  55 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  50.71 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  50.71 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  50.71 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1627  UspA domain-containing protein  50.71 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2543  UspA domain protein  42.55 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  34.29 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  37.32 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  29.29 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  29.5 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  29.53 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  32.11 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30.28 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  30.41 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  28.78 
 
 		 283 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  30.87 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  27.34 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  29.79 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  28.78 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  29.08 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  32.17 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.06 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1165  hypothetical protein  28.37 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  26.03 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  29.37 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  28.06 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  28.75 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  31.69 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  31.25 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  29.8 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  31.29 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  31.08 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  26.81 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  30.82 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  27.14 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  29.45 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  26.09 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  30.82 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  23.74 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  25.9 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  26.03 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  26.24 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  27.78 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  29.29 
 
 		 154 aa  50.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  25.9 
 
 		 297 aa  50.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  25.52 
 
 		 140 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  28.17 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.44 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  24.83 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  26.43 
 
 		 287 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  25 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  47.62 
 
 		 295 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  33.71 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  35.94 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.03 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  25.87 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  27.14 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  24.22 
 
 		 297 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.08 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  24.46 
 
 		 310 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  31.03 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1741  hypothetical protein  28.67 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.447862  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  28.78 
 
 		 280 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  26.76 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  28.29 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  29.63 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.41 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 281 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  24.46 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  24.82 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  30.09 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  27.27 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  25.35 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  24.14 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  31.94 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>