More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1627 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1627  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  280  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  69.29 
 
 		 140 aa  205  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  68.57 
 
 		 140 aa  203  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  67.14 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  69.5 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  66.43 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  60.71 
 
 		 140 aa  179  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  49.29 
 
 		 140 aa  140  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3700  hypothetical protein  50.71 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  51.06 
 
 		 140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2543  UspA domain protein  35.46 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  36.69 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  35.97 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  34.53 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3628  UspA domain protein  35.25 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  38.03 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1165  hypothetical protein  30.22 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  31.21 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  30.77 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  32 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.5 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  30 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  33.56 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  32.17 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  30.87 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  28.99 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  29.5 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  33.78 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  33.78 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  28.86 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.43 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.99 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  28.99 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  44.44 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  27.08 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  31.21 
 
 		 280 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.87 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  27.74 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  57.45 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  27.46 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  41.25 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  34.04 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  28.06 
 
 		 283 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.72 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  26.62 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  33.57 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 		 276 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  31.94 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  33.33 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  32.65 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  41.89 
 
 		 279 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 297 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  26.36 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  32.21 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  33.78 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  36.91 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  30.34 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  25.36 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  25.36 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  25.36 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  25.36 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  25.36 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  39.44 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  30.82 
 
 		 322 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  25.36 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.22 
 
 		 305 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  28.99 
 
 		 280 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  39.44 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  45.1 
 
 		 325 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  35.8 
 
 		 287 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  44.23 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  23.97 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  43.64 
 
 		 515 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  30.09 
 
 		 627 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  51.92 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1741  hypothetical protein  28.77 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.447862  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  41.18 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  26.95 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  32.97 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  30.87 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>