More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_12860 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 620 aa  1234    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  56.51 
 
 		 585 aa  662    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  60.51 
 
 		 585 aa  628  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  52.78 
 
 		 606 aa  503  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  47.69 
 
 		 714 aa  488  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  49.25 
 
 		 620 aa  473  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  47.85 
 
 		 635 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  43.82 
 
 		 661 aa  396  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  52.51 
 
 		 670 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  51.41 
 
 		 640 aa  363  5.0000000000000005e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  41.39 
 
 		 584 aa  353  4e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  40.39 
 
 		 581 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  38.54 
 
 		 564 aa  331  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  41.79 
 
 		 547 aa  331  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  46.17 
 
 		 684 aa  325  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  38.42 
 
 		 566 aa  325  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  40.07 
 
 		 538 aa  301  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  40.12 
 
 		 550 aa  291  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  43.94 
 
 		 674 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  43.5 
 
 		 680 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  47.21 
 
 		 607 aa  276  9e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  42.38 
 
 		 605 aa  258  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  45.09 
 
 		 603 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  40.72 
 
 		 653 aa  240  6.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  41.07 
 
 		 666 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  37.99 
 
 		 656 aa  231  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  43.07 
 
 		 617 aa  226  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  42.77 
 
 		 599 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 496 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  43.84 
 
 		 573 aa  217  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  44.52 
 
 		 649 aa  206  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  42.07 
 
 		 598 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  42.07 
 
 		 598 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  42.07 
 
 		 598 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  42.63 
 
 		 632 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  31.24 
 
 		 977 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  30.51 
 
 		 989 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  29.3 
 
 		 885 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  31.47 
 
 		 900 aa  186  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  31.1 
 
 		 487 aa  181  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  31.06 
 
 		 461 aa  180  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  31.71 
 
 		 464 aa  180  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  30.06 
 
 		 474 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.47 
 
 		 911 aa  176  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  31.77 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  31.76 
 
 		 855 aa  171  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  37.5 
 
 		 461 aa  169  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  28.94 
 
 		 470 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  29.6 
 
 		 470 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  29.6 
 
 		 470 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  29.77 
 
 		 534 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  28.57 
 
 		 533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  29.64 
 
 		 471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  27.91 
 
 		 533 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.44 
 
 		 856 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  29.91 
 
 		 533 aa  163  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.47 
 
 		 853 aa  162  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  29.87 
 
 		 594 aa  161  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  28.48 
 
 		 465 aa  160  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  29.07 
 
 		 515 aa  160  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  29.86 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  28.17 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  29.13 
 
 		 493 aa  159  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  28.73 
 
 		 533 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  31.07 
 
 		 533 aa  158  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  29.41 
 
 		 495 aa  158  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  28.08 
 
 		 489 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  35.1 
 
 		 403 aa  157  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  31.41 
 
 		 530 aa  157  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  30.6 
 
 		 533 aa  157  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  31 
 
 		 532 aa  157  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  28.27 
 
 		 465 aa  156  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  30.84 
 
 		 532 aa  156  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  27.49 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  28.79 
 
 		 533 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  28.57 
 
 		 464 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  28.24 
 
 		 532 aa  154  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  30.15 
 
 		 605 aa  154  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  28.05 
 
 		 489 aa  154  5e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  29.66 
 
 		 535 aa  153  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  32.43 
 
 		 735 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  27 
 
 		 525 aa  151  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  29.88 
 
 		 495 aa  151  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.63 
 
 		 848 aa  150  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  27.52 
 
 		 761 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  29.06 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  29.48 
 
 		 503 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  30.64 
 
 		 740 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  29.55 
 
 		 512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  27.73 
 
 		 554 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  28.87 
 
 		 532 aa  148  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  29.84 
 
 		 551 aa  147  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  35.19 
 
 		 594 aa  147  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  35.19 
 
 		 594 aa  147  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  28.25 
 
 		 534 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  29.52 
 
 		 532 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  28.18 
 
 		 535 aa  146  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.83 
 
 		 849 aa  146  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.06 
 
 		 856 aa  146  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  31.29 
 
 		 533 aa  146  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>