154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0760 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0760  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 800 aa  1543    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0281555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1051  TPR repeat-containing protein  55.12 
 
 		 792 aa  717    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0797  SARP family transcriptional regulator  50.19 
 
 		 565 aa  207  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.999695  normal  0.265845 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3205  hypothetical protein  44.36 
 
 		 562 aa  192  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000812064 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3442  hypothetical protein  44.36 
 
 		 562 aa  192  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.175403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  28.29 
 
 		 782 aa  85.9  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  27.53 
 
 		 1266 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.43 
 
 		 609 aa  68.9  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 1060 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.07 
 
 		 991 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1238 aa  66.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.57 
 
 		 810 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 878 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.63 
 
 		 1186 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  26.04 
 
 		 985 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  28.82 
 
 		 2145 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  27.83 
 
 		 725 aa  62  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 465 aa  62  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 589 aa  60.8  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  28.7 
 
 		 1288 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 1276 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.42 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  30.19 
 
 		 1131 aa  58.9  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 843 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 718 aa  58.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  28.3 
 
 		 1180 aa  57.4  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 1298 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  35.43 
 
 		 992 aa  57.4  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 632 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 		 1162 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 412 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  32.4 
 
 		 672 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.26 
 
 		 1252 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1025 aa  55.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 1261 aa  55.5  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  36 
 
 		 996 aa  55.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 700 aa  55.1  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.48 
 
 		 1162 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  24.08 
 
 		 828 aa  54.3  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31.07 
 
 		 1022 aa  54.3  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  33.61 
 
 		 1017 aa  54.3  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  35.71 
 
 		 792 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 1105 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.92 
 
 		 568 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 568 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  29.23 
 
 		 977 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  27.11 
 
 		 755 aa  52.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  30.97 
 
 		 708 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 		 1252 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.9 
 
 		 957 aa  51.6  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27 
 
 		 1328 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 833 aa  51.6  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  27.72 
 
 		 1027 aa  51.6  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 597 aa  51.6  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 408 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  31.93 
 
 		 935 aa  51.6  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 542 aa  51.2  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 847 aa  50.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 739 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 927 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  28.72 
 
 		 1143 aa  50.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.67 
 
 		 576 aa  50.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 949 aa  50.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.93 
 
 		 560 aa  50.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  25.14 
 
 		 740 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 649 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  28.57 
 
 		 910 aa  49.7  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.35 
 
 		 999 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 543 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.49 
 
 		 1056 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1550 aa  50.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 467 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 534 aa  49.3  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  29.19 
 
 		 1020 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  26.62 
 
 		 1507 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 850 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 726 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 685 aa  48.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.23 
 
 		 1666 aa  48.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.82 
 
 		 875 aa  48.1  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  25 
 
 		 694 aa  47.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.21 
 
 		 732 aa  47.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  23.87 
 
 		 822 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 596 aa  47.8  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 955 aa  47.8  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 		 714 aa  47.8  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 505 aa  47.8  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.6 
 
 		 249 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 909 aa  47.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  25 
 
 		 689 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 732 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.6 
 
 		 1291 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 		 1313 aa  47.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  36.17 
 
 		 1204 aa  47  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 913 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 775 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 217 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 571 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 994 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.98 
 
 		 767 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>