More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1158 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1158  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
753 aa  1509    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1355  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  49.26 
 
 
582 aa  386  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1348  putative PAS/PAC sensor protein  42.02 
 
 
888 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0270  putative PAS/PAC sensor protein  62.61 
 
 
630 aa  298  3e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
1039 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.22 
 
 
619 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 
737 aa  164  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.01 
 
 
1338 aa  160  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0499  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  34.96 
 
 
933 aa  128  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292591  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  25.09 
 
 
906 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 
603 aa  119  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2251  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.97 
 
 
351 aa  117  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.258726 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2294  histidine kinase  39.73 
 
 
381 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.02124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  24.71 
 
 
1019 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1769  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  27.39 
 
 
1343 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221131  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1139  putative PAS/PAC sensor protein  37.64 
 
 
378 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1147  putative PAS/PAC sensor protein  39.13 
 
 
340 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2294  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.33 
 
 
518 aa  107  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1366  probable regulatory protein, LuxR domain protein  41.91 
 
 
324 aa  107  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 
1741 aa  104  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 
1439 aa  104  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.66 
 
 
1261 aa  103  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  33.82 
 
 
477 aa  102  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.23 
 
 
1369 aa  102  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2443  histidine kinase  35.63 
 
 
578 aa  102  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  24.96 
 
 
1390 aa  101  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  24.91 
 
 
1053 aa  100  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  33.97 
 
 
598 aa  99.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.45 
 
 
1134 aa  99.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1107  putative PAS/PAC sensor protein  53.93 
 
 
449 aa  98.6  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316445  normal  0.383649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 
3706 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  29.88 
 
 
749 aa  95.5  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 
807 aa  95.5  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 
637 aa  95.1  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0421  putative PAS/PAC sensor protein  30.2 
 
 
357 aa  94.4  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.192636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
968 aa  93.6  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
1276 aa  92.8  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0006  putative PAS/PAC sensor protein  34.72 
 
 
412 aa  92  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.533638  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.01 
 
 
1419 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  24.64 
 
 
1379 aa  89.4  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 
891 aa  89  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2548  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
861 aa  89  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  27.72 
 
 
836 aa  88.6  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 
844 aa  87.4  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  53.85 
 
 
340 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0440  putative PAS/PAC sensor protein  48.28 
 
 
686 aa  86.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  30.62 
 
 
479 aa  86.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  30.66 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.16 
 
 
1127 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3718  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
826 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  25.65 
 
 
1248 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2710  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.06 
 
 
585 aa  84  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.132036  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.45 
 
 
1111 aa  83.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
793 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
655 aa  82.8  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0867  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 
905 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.768776  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.21 
 
 
1791 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 
761 aa  82  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2546  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.01 
 
 
804 aa  81.6  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  25.32 
 
 
1182 aa  81.6  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 
1138 aa  81.3  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.28 
 
 
843 aa  81.3  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.62 
 
 
1453 aa  80.9  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  28.51 
 
 
474 aa  80.9  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  23.51 
 
 
1560 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2710  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
756 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.438958  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2333  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.92 
 
 
578 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
909 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 
1267 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 
904 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
1028 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.74 
 
 
873 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1945  putative PAS/PAC sensor protein  30.88 
 
 
676 aa  79  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.62 
 
 
1148 aa  79  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1120  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
805 aa  79  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37757  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 
780 aa  79  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
1399 aa  78.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 
1329 aa  78.6  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  24.09 
 
 
886 aa  78.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  24.71 
 
 
935 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1931  transcriptional regulator  24.47 
 
 
935 aa  77.8  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0687  putative PAS/PAC sensor protein  22.33 
 
 
914 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000503319  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  24.26 
 
 
445 aa  77.8  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
748 aa  77.8  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
771 aa  77.4  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  29.95 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.91 
 
 
1122 aa  77.4  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.45 
 
 
1560 aa  77  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
1055 aa  77.4  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
922 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
883 aa  76.6  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 
2072 aa  76.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.21 
 
 
819 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  23.78 
 
 
1079 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
842 aa  76.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 
1069 aa  76.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 
655 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2537  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 
1222 aa  75.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  24.07 
 
 
917 aa  75.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  30.77 
 
 
1092 aa  75.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>