More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1382 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  287  4e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  60.28 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  56.34 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  56.34 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  46.1 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  40.43 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  41.91 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  37.32 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  36.76 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  37.06 
 
 		 147 aa  86.7  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  35.71 
 
 		 148 aa  86.7  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  37.59 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.46 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.69 
 
 		 148 aa  84  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  33.33 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  38.73 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  35.66 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  35 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.21 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.21 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.94 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.65 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.97 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  36.88 
 
 		 294 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  30.71 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.33 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  32.67 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  36.17 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  34.27 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  31.29 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  33.1 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.29 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  33.33 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  33.1 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  35.71 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  29.79 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  30.82 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  36.72 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.65 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  34.27 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  29.08 
 
 		 208 aa  70.5  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  32.65 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  30.5 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  34.51 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  34.23 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  36.05 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.95 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  33.11 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  32.88 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  34.51 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.17 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  35.33 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 163 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  36.3 
 
 		 155 aa  67  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  30 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0542  hypothetical protein  34.46 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  32.64 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  31.33 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  35.92 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  32.88 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  35.06 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  32.88 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  32.88 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  32.88 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  31.91 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  32.88 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  32.88 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  32.88 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  28.47 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  32.88 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  31.79 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.86 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  32.88 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>