106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3653 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  75.11 
 
 		 659 aa  1046    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  100 
 
 		 659 aa  1367    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  52.96 
 
 		 660 aa  691    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  44.95 
 
 		 663 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  42.84 
 
 		 668 aa  536  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  42.62 
 
 		 659 aa  535  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  42.77 
 
 		 655 aa  520  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  44.34 
 
 		 610 aa  492  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  39.58 
 
 		 663 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  40.42 
 
 		 672 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  39.48 
 
 		 661 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  40.18 
 
 		 674 aa  459  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  39.32 
 
 		 661 aa  450  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  39.67 
 
 		 672 aa  452  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  40.52 
 
 		 662 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  37.76 
 
 		 657 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  37.61 
 
 		 657 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  38.19 
 
 		 681 aa  425  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  35.42 
 
 		 712 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  37.81 
 
 		 686 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  39.2 
 
 		 672 aa  422  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  37.34 
 
 		 675 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  37.2 
 
 		 651 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  37.3 
 
 		 678 aa  412  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  37.16 
 
 		 652 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  37.96 
 
 		 641 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  36.62 
 
 		 678 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  36.04 
 
 		 657 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  38.29 
 
 		 693 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  35.75 
 
 		 687 aa  392  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  36.11 
 
 		 720 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  38.05 
 
 		 693 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  37.59 
 
 		 692 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  35.13 
 
 		 660 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.18 
 
 		 662 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  34.94 
 
 		 614 aa  343  8e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  35.25 
 
 		 611 aa  335  2e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.44 
 
 		 659 aa  328  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.33 
 
 		 651 aa  294  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  30.68 
 
 		 658 aa  287  5e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.52 
 
 		 656 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.85 
 
 		 565 aa  280  6e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.63 
 
 		 1433 aa  192  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  24.89 
 
 		 1526 aa  109  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  26.56 
 
 		 1537 aa  95.1  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  21.88 
 
 		 1593 aa  80.1  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.88 
 
 		 725 aa  68.9  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.96 
 
 		 735 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.99 
 
 		 723 aa  65.1  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.87 
 
 		 720 aa  61.6  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.23 
 
 		 776 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.62 
 
 		 718 aa  59.7  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  26.06 
 
 		 734 aa  59.7  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.06 
 
 		 751 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.01 
 
 		 732 aa  58.9  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  24.74 
 
 		 675 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  24.48 
 
 		 758 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.74 
 
 		 776 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.74 
 
 		 776 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.39 
 
 		 682 aa  57.8  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.89 
 
 		 722 aa  57.4  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  24.68 
 
 		 770 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.48 
 
 		 770 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.48 
 
 		 797 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.06 
 
 		 741 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.65 
 
 		 759 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.84 
 
 		 726 aa  54.7  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.06 
 
 		 741 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.75 
 
 		 734 aa  53.5  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  22.67 
 
 		 758 aa  53.9  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.11 
 
 		 721 aa  53.5  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.31 
 
 		 781 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  23.19 
 
 		 757 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.12 
 
 		 764 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.94 
 
 		 765 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.65 
 
 		 720 aa  51.6  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.19 
 
 		 757 aa  51.2  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.29 
 
 		 760 aa  50.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.26 
 
 		 746 aa  50.8  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.5 
 
 		 778 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.81 
 
 		 719 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.26 
 
 		 741 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.26 
 
 		 740 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.3 
 
 		 778 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.5 
 
 		 778 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.3 
 
 		 731 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.64 
 
 		 698 aa  48.5  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.44 
 
 		 735 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.92 
 
 		 723 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.94 
 
 		 740 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.96 
 
 		 623 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.88 
 
 		 740 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  23.72 
 
 		 737 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.39 
 
 		 732 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  23.33 
 
 		 729 aa  45.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5513  hypothetical protein  23.73 
 
 		 581 aa  45.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  21.5 
 
 		 733 aa  45.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.77 
 
 		 708 aa  45.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  21.13 
 
 		 715 aa  44.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  22.68 
 
 		 740 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>