More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3021 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3021  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  997    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0380667  normal  0.511265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.73 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  32.32 
 
 		 292 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  30.41 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  26.73 
 
 		 615 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  26.44 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1155  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  26.91 
 
 		 407 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  30.46 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  28.93 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  28.93 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  30.77 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  33.1 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.67 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.79 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  27.69 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  28.7 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  31.43 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  31.43 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  31.43 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  31.43 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  32.14 
 
 		 442 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.35 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  28.37 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  28.37 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  28.77 
 
 		 572 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  32.58 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  31.21 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.11 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  27.98 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  29.49 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  31.21 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  28.37 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  31.21 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  30.71 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.92 
 
 		 1005 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  33.33 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  31.21 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  29.79 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  29.79 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  29.29 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  24.65 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  34.29 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  29.79 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  25.68 
 
 		 567 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  28.37 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  30.5 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  29.79 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  30.29 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  30.28 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  25 
 
 		 446 aa  66.6  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  23.41 
 
 		 1040 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  23 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  28.69 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  26.95 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.11 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  29.08 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  29.13 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  28.69 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  28.69 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  26.95 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  25.62 
 
 		 676 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  26.95 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  27.14 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  24.53 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.1 
 
 		 667 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.85 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1209  winged helix family two component response transcriptional regulator  23.75 
 
 		 714 aa  64.7  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310847  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  26.5 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1042 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  27.66 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  31.91 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  25.41 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  27.82 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  24 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  25.23 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  24.9 
 
 		 969 aa  63.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  29.86 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  29.86 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  24.37 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  30.07 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  26.63 
 
 		 430 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 		 646 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.37 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  28.67 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  28.68 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  25.67 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  28.68 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  29.8 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  24.24 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  24.71 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  22.18 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.06 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0859  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  29.79 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  24.15 
 
 		 717 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.77 
 
 		 446 aa  62  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.66 
 
 		 446 aa  62  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  44.26 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>