More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2682 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  100 
 
 		 925 aa  1870    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  89.72 
 
 		 922 aa  1667    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  82.72 
 
 		 927 aa  1581    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0106  helicase domain-containing protein  77.1 
 
 		 443 aa  678    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0102  SNF2-related protein  87.94 
 
 		 346 aa  625  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  31.91 
 
 		 877 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  30.75 
 
 		 805 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0104  hypothetical protein  80.65 
 
 		 297 aa  296  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  29.38 
 
 		 801 aa  290  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28.65 
 
 		 988 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  29.97 
 
 		 937 aa  264  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  30.01 
 
 		 900 aa  256  9e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  32.79 
 
 		 941 aa  254  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  32.79 
 
 		 941 aa  254  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  30.04 
 
 		 1172 aa  253  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  32.97 
 
 		 962 aa  253  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  31.5 
 
 		 1167 aa  251  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  28.66 
 
 		 969 aa  251  6e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  29.54 
 
 		 894 aa  251  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  31.01 
 
 		 1170 aa  250  9e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  33.67 
 
 		 1116 aa  248  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  31.5 
 
 		 1167 aa  248  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  31.47 
 
 		 1129 aa  248  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  30.36 
 
 		 1160 aa  248  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  32.07 
 
 		 1170 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1144 aa  246  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  31.65 
 
 		 835 aa  246  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  30.12 
 
 		 1170 aa  245  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  32.25 
 
 		 1172 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  30.9 
 
 		 1170 aa  243  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  31.33 
 
 		 1167 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.4 
 
 		 1212 aa  241  5.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  31.8 
 
 		 1145 aa  241  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  30.83 
 
 		 1138 aa  236  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  32.3 
 
 		 1147 aa  234  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  30.01 
 
 		 966 aa  233  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  32.11 
 
 		 972 aa  232  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  28.85 
 
 		 1160 aa  231  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  30.28 
 
 		 1169 aa  229  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  28.03 
 
 		 971 aa  229  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  29.66 
 
 		 1169 aa  226  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  30.35 
 
 		 964 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  29.73 
 
 		 969 aa  217  8e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  28.18 
 
 		 829 aa  212  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  27.6 
 
 		 1062 aa  204  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  29.16 
 
 		 951 aa  185  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  35.69 
 
 		 1194 aa  181  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  28.47 
 
 		 1069 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  28.47 
 
 		 1069 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  28.03 
 
 		 947 aa  170  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  31.19 
 
 		 1168 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  28.14 
 
 		 1057 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  31.53 
 
 		 440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  27.23 
 
 		 1045 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  28.82 
 
 		 942 aa  161  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  33.67 
 
 		 1137 aa  162  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  31.41 
 
 		 1165 aa  160  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  27.01 
 
 		 963 aa  159  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  26.89 
 
 		 1031 aa  159  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  29.18 
 
 		 952 aa  159  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  29.82 
 
 		 955 aa  159  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  28.04 
 
 		 949 aa  159  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  32.84 
 
 		 933 aa  159  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  27.77 
 
 		 961 aa  158  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  26.51 
 
 		 975 aa  157  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  29 
 
 		 1046 aa  157  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  26.06 
 
 		 1013 aa  156  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  32.55 
 
 		 1136 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  29.01 
 
 		 1094 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  26.44 
 
 		 963 aa  156  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  28.3 
 
 		 921 aa  155  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  28.48 
 
 		 1201 aa  151  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  28.48 
 
 		 1201 aa  151  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  29.56 
 
 		 1095 aa  148  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  27.15 
 
 		 964 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  29.87 
 
 		 1049 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  30.53 
 
 		 919 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  27.82 
 
 		 953 aa  140  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  33.33 
 
 		 283 aa  139  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  25.97 
 
 		 1177 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  33.44 
 
 		 572 aa  139  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  28.77 
 
 		 814 aa  138  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  27.17 
 
 		 1058 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  32.49 
 
 		 584 aa  130  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  40.2 
 
 		 1065 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  40.2 
 
 		 1065 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  32.49 
 
 		 584 aa  130  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  27 
 
 		 1082 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.17 
 
 		 1028 aa  127  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3131  ATP-dependent helicase HepA  35.83 
 
 		 967 aa  125  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  27.38 
 
 		 948 aa  125  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  31.17 
 
 		 969 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  31.68 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  31.69 
 
 		 968 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  31.27 
 
 		 968 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  34.34 
 
 		 968 aa  122  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3733  ATP-dependent helicase HepA  31.01 
 
 		 968 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3916  ATP-dependent helicase HepA  31.01 
 
 		 968 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  34.48 
 
 		 947 aa  122  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  35.41 
 
 		 968 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>