More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01212 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  100 
 
 		 336 aa  701    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  29.55 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  28.04 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  34.16 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  28.01 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  28.93 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  27.55 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  34.45 
 
 		 395 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  25.21 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  26.76 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  26.39 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  27.6 
 
 		 334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  26.63 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  30.73 
 
 		 222 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  28.84 
 
 		 347 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  26.05 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  26.24 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  26.24 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  28.02 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  30.5 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  30.12 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  25.36 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  25.96 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  27.47 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  29.96 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  25.36 
 
 		 351 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  29.41 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  26.41 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  30.6 
 
 		 374 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  26.88 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  26.85 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  26.19 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  25.78 
 
 		 381 aa  99.8  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1220  integrase  30.22 
 
 		 286 aa  98.2  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  27.68 
 
 		 380 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  26.71 
 
 		 354 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  26.71 
 
 		 354 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1421  phage integrase family protein  24.04 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  28.51 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  27.45 
 
 		 366 aa  85.9  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  27.14 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2042  integrase family protein  24.86 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0960893  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  27.03 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  21.54 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  24.14 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  26.12 
 
 		 531 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  23.58 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1794  integrase family protein  25.64 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0543031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  28.22 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  22.7 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  25.29 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  24.15 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3193  integrase family protein  23.61 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  26.46 
 
 		 387 aa  75.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2610  integrase family protein  23.6 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0241311  unclonable  5.16639e-16 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  24.88 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2576  integrase family protein  23.6 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.478177  hitchhiker  0.000378812 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2234  integrase family protein  26.65 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3278  phage integrase family site specific recombinase  32.77 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  24.51 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  25.56 
 
 		 387 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  28.04 
 
 		 353 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.96 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  23.15 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  25.65 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  25.37 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  27.1 
 
 		 571 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  27.72 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  24.51 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  23.46 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  24.51 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  26.38 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  26.38 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  28.47 
 
 		 159 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  26.38 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  26.38 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  25.16 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  30.06 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  26.09 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  27.31 
 
 		 396 aa  67  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  29.22 
 
 		 429 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  26.49 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2030  phage integrase family protein  23.77 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  25.22 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  25.96 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  26.32 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3455  putative integrase/recombinase  28.46 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375642  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1152  integrase family protein  21.93 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.379304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0354  phage integrase family site specific recombinase  28.93 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  29.71 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2363  phage integrase family site specific recombinase  30.16 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1667  phage integrase family protein  28.49 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  24.31 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  27.68 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1439  integrase family protein  27.48 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.110569  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  24 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  24.24 
 
 		 276 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  22.67 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  29.34 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  22.69 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>