More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4851 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4851  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 382 aa  752    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141965  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1678  signal transduction histidine kinase  73.41 
 
 		 348 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  61.07 
 
 		 351 aa  351  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  61.41 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  60.74 
 
 		 338 aa  350  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  53.85 
 
 		 341 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4126  signal transduction histidine kinase  51.1 
 
 		 345 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 334 aa  219  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 		 325 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 		 358 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3243  hypothetical protein  40.68 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.87962  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  37.93 
 
 		 744 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 603 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 416 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 572 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 613 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 739 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  34.62 
 
 		 1239 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 532 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 757 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 878 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 3706 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 774 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.29 
 
 		 1663 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 815 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 387 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 354 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 871 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 682 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 1560 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  31.97 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1654 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 681 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 964 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 1676 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.21 
 
 		 1668 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 782 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 551 aa  106  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 875 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 991 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1093 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 215 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.26 
 
 		 895 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1093 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 1714 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 832 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 524 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 771 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 657 aa  103  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 465 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 864 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 874 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 941 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 526 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 545 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 1390 aa  101  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 732 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0255  sensor histidine kinase  33.02 
 
 		 480 aa  101  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 752 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 771 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1659  sensor histidine kinase  34.95 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 347 aa  99.8  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 813 aa  99.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 662 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 461 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 872 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 358 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  29.35 
 
 		 624 aa  97.8  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 732 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 764 aa  97.1  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 547 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1607  sensor histidine kinase  34.95 
 
 		 437 aa  97.1  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 749 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 431 aa  96.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3225  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 541 aa  96.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 1051 aa  96.7  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3963  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 538 aa  96.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1210 aa  96.7  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 1051 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 462 aa  96.7  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  29.82 
 
 		 783 aa  96.7  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 839 aa  96.3  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 400 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>