146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3913 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3913  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20842  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3163  transcriptional regulator, TetR family  80.17 
 
 		 242 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  49.01 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  47.37 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  46.89 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  45.25 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0553  TetR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 233 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3728  TetR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 217 aa  185  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0951  transcriptional regulator, TetR family  47.03 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 214 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5853  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 230 aa  178  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0081  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0649  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899851  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2128  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  39.19 
 
 		 251 aa  48.5  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4153  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  36.14 
 
 		 226 aa  48.5  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  39.39 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1492  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1810  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2113  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.473372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0479  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0381  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0796  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  43.64 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  45.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 191 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 203 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 205 aa  45.1  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 217 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 330 aa  45.4  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1430  regulatory protein TetR  34.74 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  25.17 
 
 		 346 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  30.43 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3539  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>