117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10520 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  61.72 
 
 		 586 aa  697    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  63.97 
 
 		 593 aa  747    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  61.82 
 
 		 591 aa  726    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  59.87 
 
 		 593 aa  702    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  60.45 
 
 		 598 aa  682    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  59.54 
 
 		 566 aa  650    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  58.42 
 
 		 574 aa  639    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  60.95 
 
 		 582 aa  718    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  58.7 
 
 		 565 aa  656    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  59.01 
 
 		 622 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  64.76 
 
 		 628 aa  731    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  61.95 
 
 		 593 aa  733    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  62.95 
 
 		 618 aa  729    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  62.63 
 
 		 606 aa  721    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  59.36 
 
 		 599 aa  700    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  100 
 
 		 589 aa  1193    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  62.33 
 
 		 606 aa  718    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  64.04 
 
 		 621 aa  753    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  62.79 
 
 		 601 aa  729    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  58 
 
 		 574 aa  634  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  58.63 
 
 		 572 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  55.28 
 
 		 592 aa  629  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  56.61 
 
 		 626 aa  627  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  55.86 
 
 		 595 aa  622  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  60.25 
 
 		 569 aa  621  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  56.71 
 
 		 560 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  56.71 
 
 		 560 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  56.71 
 
 		 560 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  55.34 
 
 		 563 aa  604  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  57.39 
 
 		 577 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  57.34 
 
 		 575 aa  601  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  57.56 
 
 		 601 aa  596  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  46.72 
 
 		 583 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  47.8 
 
 		 594 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  44.33 
 
 		 598 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  40.07 
 
 		 559 aa  348  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  32.56 
 
 		 477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  31.06 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  31.17 
 
 		 472 aa  163  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  31.17 
 
 		 472 aa  163  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  30.56 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  29.97 
 
 		 469 aa  160  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  30.29 
 
 		 471 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  30.29 
 
 		 471 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  30.21 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  31.37 
 
 		 465 aa  150  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  29.44 
 
 		 466 aa  146  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  28.42 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  28.69 
 
 		 465 aa  145  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  29.62 
 
 		 464 aa  144  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  31.25 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  26.73 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  32.62 
 
 		 429 aa  122  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  30.73 
 
 		 456 aa  115  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  29.1 
 
 		 435 aa  115  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  29.89 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  27.25 
 
 		 622 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  28.67 
 
 		 601 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  28.2 
 
 		 608 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  24.49 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  26 
 
 		 558 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  24.71 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  20.28 
 
 		 698 aa  66.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  23.27 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  26.33 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  25.59 
 
 		 706 aa  63.9  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  24.94 
 
 		 765 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  21.64 
 
 		 696 aa  55.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  26.03 
 
 		 995 aa  54.3  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  27.04 
 
 		 791 aa  53.9  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  22.77 
 
 		 732 aa  53.5  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  27.23 
 
 		 464 aa  53.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  25.59 
 
 		 440 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  23 
 
 		 491 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  24.26 
 
 		 815 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  21.31 
 
 		 715 aa  52  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  23.48 
 
 		 932 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4614  EcoEI R domain-containing protein  21.5 
 
 		 790 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000837819 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  30.11 
 
 		 949 aa  52  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  22.63 
 
 		 800 aa  52  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  22.38 
 
 		 796 aa  52  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  27.45 
 
 		 949 aa  51.6  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  21.18 
 
 		 993 aa  51.6  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  23.48 
 
 		 932 aa  51.6  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  23.45 
 
 		 945 aa  50.4  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  23.47 
 
 		 1005 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02070  type I restriction enzyme EcoAI R protein  22.11 
 
 		 793 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  28.73 
 
 		 489 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  28.73 
 
 		 489 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  25.07 
 
 		 1066 aa  48.9  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  25.3 
 
 		 899 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  21.27 
 
 		 809 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3974  type III restriction enzyme, res subunit  23.51 
 
 		 1093 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361688  normal  0.0160055 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  23.99 
 
 		 443 aa  47.8  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  29.13 
 
 		 953 aa  47.4  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  29.13 
 
 		 953 aa  47.4  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  22.71 
 
 		 531 aa  46.6  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  23.5 
 
 		 946 aa  47  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  22.94 
 
 		 951 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>