More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1691 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  100 
 
 		 402 aa  809    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  30.41 
 
 		 453 aa  156  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000543052  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  34.57 
 
 		 396 aa  156  8e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  30.47 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  30.68 
 
 		 397 aa  122  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  34.28 
 
 		 402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1587  hypothetical protein  41.67 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.806323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1641  hypothetical protein  41.67 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.931183 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1616  hypothetical protein  41.67 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  33.12 
 
 		 363 aa  106  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  32.33 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  28.05 
 
 		 325 aa  103  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  32.53 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  31.16 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  27.64 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  30.45 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  29.71 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  31.75 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.87 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  29.43 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  28.34 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.25 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.76 
 
 		 376 aa  90.5  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  28 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.57 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  28.43 
 
 		 371 aa  88.2  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  30.6 
 
 		 433 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  27.81 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  31.82 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  30.07 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  30.14 
 
 		 305 aa  87  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  27.94 
 
 		 386 aa  86.7  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.6 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  26.9 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  27.99 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  28.35 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  27.4 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.87 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  28.61 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.23 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  29.9 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  24.37 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  28.35 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  28.78 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  30.31 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  27.33 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  30.5 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  28.77 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  24.64 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  32.47 
 
 		 275 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  27.3 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  28.34 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  27.02 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  29.37 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  25.84 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.89 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  25.67 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.68 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  28.89 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  24.39 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.38 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.84 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  27.03 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  25.38 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  27.61 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  32.99 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  26.97 
 
 		 506 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  24.54 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  29.34 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  24.54 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  27.68 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1590  phage integrase family protein  35.76 
 
 		 198 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  29.58 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  29.58 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  26.47 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.6 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.6 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  25.08 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  29.08 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  25 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  25.33 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  24.48 
 
 		 283 aa  69.7  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  23.58 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  31.82 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  27.91 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  24.03 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  26.45 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  30.27 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  27.14 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  25.8 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  35.1 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  31.31 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  26.06 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  30.41 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>