More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1448 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1448  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 182 aa  364  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0355171  normal  0.193745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3503  TetR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 200 aa  127  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2449  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4581  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.133815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5181  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 400 aa  52  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 271 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 228 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  51.6  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 197 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 264 aa  51.2  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 222 aa  51.2  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 217 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 220 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  39.29 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  41.75 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  39.68 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 238 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 206 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 245 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  27.44 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 209 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 200 aa  48.5  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 236 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 226 aa  48.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 197 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 218 aa  48.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 193 aa  48.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 220 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 208 aa  47.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  34.83 
 
 		 226 aa  47.8  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  26.67 
 
 		 237 aa  47.8  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 215 aa  47.8  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 202 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 216 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 236 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 238 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 227 aa  47.8  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 309 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  36.92 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1794  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 244 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 280 aa  47.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  36.23 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 248 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>