106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2711 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2711  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.592354  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3037  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.58 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1680  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.98 
 
 		 208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.744981 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0691  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.38 
 
 		 222 aa  161  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0320  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.39 
 
 		 211 aa  128  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495226  normal  0.0608839 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0019  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.56 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67767  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3908  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.48 
 
 		 267 aa  109  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.40887  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2080  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.58 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.231925  normal  0.169776 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  35.21 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  32.35 
 
 		 537 aa  69.7  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  32.77 
 
 		 919 aa  67.4  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  50.88 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.25 
 
 		 728 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2889  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.22 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3054  putative PAS/PAC sensor protein  47.46 
 
 		 1260 aa  63.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.08 
 
 		 598 aa  62.4  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  29.17 
 
 		 994 aa  60.1  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  44.83 
 
 		 637 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  48.53 
 
 		 539 aa  59.3  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  28.69 
 
 		 1969 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.43 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  30.72 
 
 		 680 aa  58.5  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  28.43 
 
 		 700 aa  58.9  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  30.09 
 
 		 644 aa  58.9  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  46.43 
 
 		 1071 aa  58.9  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  33.33 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3051  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  48.28 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  43.86 
 
 		 750 aa  57.4  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0138  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  50 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2580  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.87 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  28.71 
 
 		 1081 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 524 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  44.64 
 
 		 1589 aa  57  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  41.38 
 
 		 564 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.25 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 532 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.3 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3130  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.15 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  45.45 
 
 		 666 aa  55.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  39.66 
 
 		 1216 aa  55.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0458  bacterio-opsin activator  27.72 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.484707  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  30.25 
 
 		 952 aa  55.5  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 		 843 aa  55.5  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  50.91 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  48.08 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2098  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.86 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546258  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  28.93 
 
 		 712 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1167  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.78 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0347926 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  36.28 
 
 		 781 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  40.35 
 
 		 1059 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  48.15 
 
 		 896 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  40.98 
 
 		 1073 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1151  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  47.17 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.515293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1606  bacterio-opsin activator  40 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1916  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.76 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  23.44 
 
 		 982 aa  51.6  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0660  transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  30.38 
 
 		 770 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  29.13 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  41.94 
 
 		 991 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  45.28 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  30.53 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0497  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.87 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2387  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.23 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3294  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.62 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3269  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.51 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.68 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1818  bacterio-opsin activator  29.85 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.871234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.15 
 
 		 236 aa  48.5  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1556  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.09 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220409  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0834  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.15 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4109  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.23 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1983  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.38 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  26.12 
 
 		 737 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4165  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.38 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1416  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.71 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.928147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3163  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.24 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.534144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1371  putative PAS/PAC sensor protein  41.51 
 
 		 834 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1012  putative PAS/PAC sensor protein  38.33 
 
 		 1154 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0819572  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2616  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.11 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1773  bacterio-opsin activator  44.23 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1336  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.65 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292593  normal  0.783067 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0957  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.64 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4963  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.03 
 
 		 262 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.993638  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3379  putative PAS/PAC sensor protein  39.29 
 
 		 449 aa  45.4  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4262  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.33 
 
 		 269 aa  45.1  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0617  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.29 
 
 		 216 aa  45.1  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.820694  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  39.62 
 
 		 807 aa  45.4  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1676  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.29 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4299  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.33 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0553  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.93 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1800  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.93 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.434291  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  31.58 
 
 		 677 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0874  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.69 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.23 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3712  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 379 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1215  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.24 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0486  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.67 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1039  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.6 
 
 		 254 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.169994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1971  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.64 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>