85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1418 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  59.31 
 
 		 812 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  100 
 
 		 927 aa  1905    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  47.63 
 
 		 895 aa  647    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.02 
 
 		 998 aa  632  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  43.33 
 
 		 1224 aa  620  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  42.53 
 
 		 1100 aa  600  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  48.07 
 
 		 851 aa  602  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  47.01 
 
 		 864 aa  596  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.73 
 
 		 762 aa  591  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  46.29 
 
 		 875 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50.94 
 
 		 867 aa  558  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  41.01 
 
 		 885 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  51.57 
 
 		 775 aa  542  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.75 
 
 		 786 aa  535  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  38.53 
 
 		 874 aa  530  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  39.67 
 
 		 1105 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.57 
 
 		 611 aa  421  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  35.73 
 
 		 578 aa  272  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  32.78 
 
 		 587 aa  270  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  34.58 
 
 		 854 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.5 
 
 		 582 aa  267  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  32.2 
 
 		 571 aa  265  3e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  31.86 
 
 		 591 aa  260  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  30.03 
 
 		 646 aa  232  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 		 649 aa  213  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  31.14 
 
 		 537 aa  191  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  30.6 
 
 		 1601 aa  190  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  27.32 
 
 		 833 aa  152  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.07 
 
 		 900 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  28.52 
 
 		 739 aa  120  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  28.34 
 
 		 665 aa  119  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  25.73 
 
 		 803 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 		 632 aa  106  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 		 1321 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  24.25 
 
 		 606 aa  87.8  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  23.7 
 
 		 978 aa  85.9  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  25.78 
 
 		 2042 aa  84.3  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  24.94 
 
 		 742 aa  84  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25 
 
 		 1694 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1241  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  24.24 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00026508  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 		 611 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  23.44 
 
 		 1076 aa  80.1  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  23.38 
 
 		 621 aa  78.2  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  25.17 
 
 		 526 aa  75.1  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  26.34 
 
 		 794 aa  72  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  32.47 
 
 		 1414 aa  71.6  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.65 
 
 		 985 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  22.62 
 
 		 707 aa  68.6  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  24.94 
 
 		 789 aa  68.2  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  25.49 
 
 		 778 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  36.3 
 
 		 1918 aa  65.5  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  26.26 
 
 		 847 aa  64.7  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  22.25 
 
 		 725 aa  63.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.17 
 
 		 887 aa  63.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  22.47 
 
 		 883 aa  63.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  22.78 
 
 		 715 aa  63.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  26.15 
 
 		 880 aa  62.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  22.57 
 
 		 757 aa  62  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  22.05 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  30.84 
 
 		 641 aa  61.6  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  25.8 
 
 		 846 aa  60.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  33.33 
 
 		 1050 aa  60.1  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  24.23 
 
 		 686 aa  59.3  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 		 739 aa  58.2  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 642 aa  57.4  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  20.89 
 
 		 730 aa  57.4  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  27.31 
 
 		 815 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  25.25 
 
 		 854 aa  55.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  22.32 
 
 		 906 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  22.66 
 
 		 570 aa  55.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0076  glycoside hydrolase family 9  22.31 
 
 		 837 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  27.82 
 
 		 928 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  28.25 
 
 		 997 aa  53.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 		 736 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  24.43 
 
 		 990 aa  51.6  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5258  glycoside hydrolase family 9  27.03 
 
 		 653 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.35373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  23.56 
 
 		 984 aa  49.7  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  21.63 
 
 		 710 aa  48.9  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2878  histidine kinase  24.54 
 
 		 968 aa  48.9  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.799361  normal  0.0181006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 1184 aa  48.5  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  23.63 
 
 		 1255 aa  48.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  24.75 
 
 		 1137 aa  47.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  23.15 
 
 		 1369 aa  47.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  21.21 
 
 		 737 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.67 
 
 		 627 aa  46.2  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>