88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2319 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2319  integrase family protein  100 
 
 		 493 aa  1022    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2118  integrative genetic element Gsu21, integrase  32.52 
 
 		 446 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  34.06 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  32.76 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  31.34 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  34.81 
 
 		 257 aa  159  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  24.22 
 
 		 412 aa  94  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  26.76 
 
 		 471 aa  92.8  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  25.47 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  24.08 
 
 		 411 aa  88.2  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  24.57 
 
 		 401 aa  87  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2271  hypothetical protein  27.63 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000219474  hitchhiker  0.000127881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  26.12 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  24.4 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  26.21 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  22.37 
 
 		 435 aa  73.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  23.78 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  23.43 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  23.5 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  23.75 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  23.19 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  24.53 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  24.21 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  22.59 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  24.51 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  22.31 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.08 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  25.95 
 
 		 387 aa  57  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.41 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  23.73 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  21.72 
 
 		 414 aa  55.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  30.72 
 
 		 359 aa  55.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  22.65 
 
 		 363 aa  54.7  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  23.12 
 
 		 390 aa  53.9  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.94 
 
 		 389 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  22.12 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  29.19 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  20.75 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  20.75 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  23.35 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  20.75 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  22.46 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  23.08 
 
 		 384 aa  51.2  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  22.48 
 
 		 396 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03390  hypothetical protein  26.54 
 
 		 169 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000152663  unclonable  2.59325e-22 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  22.99 
 
 		 411 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  19.88 
 
 		 381 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  21.64 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  30.59 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  30.59 
 
 		 431 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  34.43 
 
 		 412 aa  48.5  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  30.59 
 
 		 426 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  22.58 
 
 		 255 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  21.97 
 
 		 370 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  23.78 
 
 		 368 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.7 
 
 		 393 aa  47.8  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  22.42 
 
 		 477 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  26.32 
 
 		 356 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  22.62 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  24.02 
 
 		 377 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  20.92 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.49 
 
 		 374 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.49 
 
 		 374 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  24.72 
 
 		 276 aa  45.8  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  23.82 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  20.16 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  24.29 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2126  integrase family protein  25.19 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  21.88 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3866  phage integrase family site specific recombinase  36 
 
 		 368 aa  44.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  20.77 
 
 		 373 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  27.42 
 
 		 354 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  27.42 
 
 		 354 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.92 
 
 		 369 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3198  phage integrase family protein  30.28 
 
 		 481 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00055916  hitchhiker  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  23.2 
 
 		 370 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  22.87 
 
 		 375 aa  44.3  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  29.41 
 
 		 411 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  29.41 
 
 		 411 aa  43.9  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  29.41 
 
 		 411 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  25.91 
 
 		 428 aa  43.5  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  21.37 
 
 		 416 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  21.59 
 
 		 275 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  25.32 
 
 		 338 aa  43.5  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  25.62 
 
 		 297 aa  43.5  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.62 
 
 		 297 aa  43.5  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>