68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2126 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2126  integrase family protein  100 
 
 		 449 aa  899    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  27.62 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  23.04 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.25 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  25.5 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  25 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  27.12 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  30.08 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2011  integrase family protein  27.03 
 
 		 442 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.91 
 
 		 369 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  28.07 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.35 
 
 		 369 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  29.61 
 
 		 385 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.88 
 
 		 376 aa  53.5  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.88 
 
 		 376 aa  53.5  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  28.32 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  27.03 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  22.73 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  20.36 
 
 		 373 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  25.26 
 
 		 301 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.85 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.24 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.53 
 
 		 392 aa  50.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  22.93 
 
 		 390 aa  50.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  24.64 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  28.32 
 
 		 418 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  22.87 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  22.87 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  28.32 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  29.92 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.56 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  25.97 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  25 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  23.79 
 
 		 396 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  28.48 
 
 		 412 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  23.67 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  28.18 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  21.7 
 
 		 376 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  23.99 
 
 		 387 aa  47  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  24.86 
 
 		 392 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  22.84 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  24.71 
 
 		 413 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.82 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2319  integrase family protein  24.46 
 
 		 493 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  25.1 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.82 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  20.76 
 
 		 376 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  25.18 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  27.72 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3678  integrase family protein  28.9 
 
 		 275 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  22.35 
 
 		 395 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  22 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  23.24 
 
 		 515 aa  43.9  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  23.15 
 
 		 419 aa  43.9  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  23.15 
 
 		 419 aa  43.9  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  26.14 
 
 		 383 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  27.33 
 
 		 436 aa  43.5  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  26.05 
 
 		 387 aa  43.5  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4354  integrase family protein  28.77 
 
 		 445 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0248698 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  27.33 
 
 		 409 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  23.62 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.59 
 
 		 397 aa  43.1  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  27.33 
 
 		 409 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  28.14 
 
 		 356 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 423 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  22.4 
 
 		 391 aa  43.1  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  27.63 
 
 		 415 aa  43.1  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>