111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3497 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  100 
 
 		 507 aa  1046    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  60.36 
 
 		 500 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  57.63 
 
 		 511 aa  578  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  57.09 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  58.99 
 
 		 500 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  58.75 
 
 		 500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  56.03 
 
 		 524 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  50.5 
 
 		 498 aa  496  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  50.6 
 
 		 494 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  51.08 
 
 		 512 aa  488  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  53.26 
 
 		 516 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  48.95 
 
 		 496 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  49.68 
 
 		 480 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  47.36 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  43.58 
 
 		 519 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  40.75 
 
 		 472 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  39.62 
 
 		 549 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  39.85 
 
 		 538 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  38.63 
 
 		 1033 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  40.17 
 
 		 450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  39.07 
 
 		 539 aa  318  1e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  37.5 
 
 		 537 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  37.94 
 
 		 465 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  38.02 
 
 		 463 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  37.6 
 
 		 463 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  37.6 
 
 		 463 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  36.89 
 
 		 436 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 		 722 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  29.22 
 
 		 446 aa  156  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  24.68 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  27.5 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  26.94 
 
 		 436 aa  144  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  29.82 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  27.62 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  24.24 
 
 		 459 aa  136  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  23.81 
 
 		 459 aa  130  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  25.43 
 
 		 452 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  25.74 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  27.97 
 
 		 448 aa  117  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  27.17 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 489 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  25.86 
 
 		 435 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  25.05 
 
 		 538 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  28.1 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  25.79 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  24.62 
 
 		 1293 aa  104  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  23.98 
 
 		 532 aa  101  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  23.57 
 
 		 449 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  22.73 
 
 		 431 aa  98.2  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  27.37 
 
 		 491 aa  97.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  20.95 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  19.91 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4557  hypothetical protein  23.33 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  23.33 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  27.37 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  23.08 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  22.22 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  18.67 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  18.08 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  25.07 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  28.49 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  25.07 
 
 		 453 aa  54.3  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  26.64 
 
 		 369 aa  53.5  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  26.4 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  25.28 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  27.72 
 
 		 647 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  27.72 
 
 		 647 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  22.83 
 
 		 428 aa  50.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  21.62 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  23.73 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  25 
 
 		 645 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  22.25 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  25.27 
 
 		 647 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  23.86 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  49.18 
 
 		 525 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  21.19 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  42.11 
 
 		 501 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  25 
 
 		 372 aa  48.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  23.33 
 
 		 462 aa  47.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  23.84 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  27.47 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  28.18 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  34.09 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  22.26 
 
 		 556 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  27.42 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  40.74 
 
 		 501 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  26.35 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  26.6 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  40.74 
 
 		 501 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  26.11 
 
 		 384 aa  45.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.33 
 
 		 483 aa  44.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  25.7 
 
 		 488 aa  44.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  41.82 
 
 		 468 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  23.43 
 
 		 473 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.48 
 
 		 431 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 		 534 aa  44.3  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  40 
 
 		 468 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  63.33 
 
 		 512 aa  43.9  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>