More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1940 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1940  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 435 aa  849    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.704243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2964  tRNA modification GTPase TrmE  51.6 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2407  tRNA modification GTPase TrmE  53.23 
 
 		 433 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3624  tRNA modification GTPase TrmE  51.78 
 
 		 455 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  52.13 
 
 		 444 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1272  tRNA modification GTPase TrmE  52.46 
 
 		 438 aa  350  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1859  tRNA modification GTPase TrmE  51.56 
 
 		 444 aa  343  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1658  tRNA modification GTPase TrmE  51.91 
 
 		 444 aa  339  7e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.296272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  50.11 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1833  tRNA modification GTPase TrmE  50.57 
 
 		 431 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0890064  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3205  tRNA modification GTPase TrmE  45.02 
 
 		 440 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4081  tRNA modification GTPase TrmE  50.45 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0162579 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0858  tRNA modification GTPase TrmE  43.74 
 
 		 442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  46.38 
 
 		 447 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2062  tRNA modification GTPase TrmE  44.29 
 
 		 442 aa  316  6e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00847213  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  46.65 
 
 		 462 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4390  tRNA modification GTPase TrmE  43.28 
 
 		 436 aa  315  8e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1411  tRNA modification GTPase TrmE  49.55 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3931  tRNA modification GTPase TrmE  44.98 
 
 		 437 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1982  tRNA modification GTPase TrmE  44.06 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.535641  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1284  tRNA modification GTPase TrmE  44.85 
 
 		 451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2587  tRNA modification GTPase TrmE  46.44 
 
 		 448 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0098  tRNA modification GTPase TrmE  44.95 
 
 		 456 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0727899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0291  tRNA modification GTPase TrmE  45.83 
 
 		 449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  45.36 
 
 		 460 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  44 
 
 		 442 aa  299  7e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0297  tRNA modification GTPase TrmE  46.53 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1230  tRNA modification GTPase TrmE  44.62 
 
 		 428 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2891  tRNA modification GTPase TrmE  44.72 
 
 		 428 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3454  tRNA modification GTPase TrmE  42.99 
 
 		 429 aa  293  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0010  tRNA modification GTPase TrmE  40.5 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000341639  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  44.16 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0164  tRNA modification GTPase TrmE  45.56 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4257  tRNA modification GTPase TrmE  43.02 
 
 		 437 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.910878 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0060  tRNA modification GTPase TrmE  37.81 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0027  tRNA modification GTPase TrmE  40.87 
 
 		 454 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0032  tRNA modification GTPase TrmE  37.25 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0005  tRNA modification GTPase TrmE  39.66 
 
 		 481 aa  277  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75194  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2864  tRNA modification GTPase TrmE  41.84 
 
 		 428 aa  276  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4234  tRNA modification GTPase TrmE  40.43 
 
 		 467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4127  tRNA modification GTPase TrmE  40.43 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4055  tRNA modification GTPase TrmE  40.43 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.765231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4070  tRNA modification GTPase TrmE  40.43 
 
 		 467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4177  tRNA modification GTPase TrmE  40.43 
 
 		 467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4263  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 		 454 aa  273  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  40.22 
 
 		 448 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0106  tRNA modification GTPase TrmE  42.92 
 
 		 457 aa  272  9e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446893  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3179  tRNA modification GTPase TrmE  40.6 
 
 		 464 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0373252  hitchhiker  0.000409063 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4292  tRNA modification GTPase TrmE  38.24 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4615  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2547  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 464 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3161  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 464 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4073  tRNA modification GTPase TrmE  39.69 
 
 		 454 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  39.78 
 
 		 454 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  39.69 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  39.69 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3152  tRNA modification GTPase TrmE  40.38 
 
 		 464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  39.69 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  39.47 
 
 		 454 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5136  tRNA modification GTPase TrmE  39.47 
 
 		 454 aa  266  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal  0.0619684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  39.47 
 
 		 454 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  39.47 
 
 		 454 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  39.47 
 
 		 454 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 464 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  37.36 
 
 		 454 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4034  tRNA modification GTPase TrmE  39.39 
 
 		 453 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461545  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3755  tRNA modification GTPase TrmE  38.76 
 
 		 481 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  37.36 
 
 		 454 aa  264  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  37.36 
 
 		 454 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6518  tRNA modification GTPase TrmE  39.53 
 
 		 464 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33876  predicted protein  40.08 
 
 		 489 aa  262  8.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.242987 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0137  tRNA modification GTPase TrmE  43.47 
 
 		 437 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3456  tRNA modification GTPase TrmE  38.33 
 
 		 481 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  37.17 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4089  tRNA modification GTPase TrmE  40.85 
 
 		 448 aa  261  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  36 
 
 		 473 aa  259  5.0000000000000005e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  36 
 
 		 452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4241  tRNA modification GTPase TrmE  37.61 
 
 		 469 aa  259  7e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207719  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0003  tRNA modification GTPase TrmE  43.39 
 
 		 419 aa  259  8e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3317  tRNA modification GTPase TrmE  40.27 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  36.95 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3984  tRNA modification GTPase TrmE  39.53 
 
 		 464 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  40.23 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2084  tRNA modification GTPase TrmE  38.15 
 
 		 457 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.103263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  37.58 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  37.74 
 
 		 455 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2757  tRNA modification GTPase TrmE  38.26 
 
 		 446 aa  256  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00435  tRNA modification GTPase TrmE  36.09 
 
 		 453 aa  256  6e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3495  tRNA modification GTPase TrmE  39.29 
 
 		 467 aa  255  9e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2881  tRNA modification GTPase TrmE  42.6 
 
 		 444 aa  255  9e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  36.87 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5298  tRNA modification GTPase TrmE  38.64 
 
 		 471 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3233  tRNA modification GTPase TrmE  39.29 
 
 		 467 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  36.93 
 
 		 456 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  36.92 
 
 		 455 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4469  tRNA modification GTPase TrmE  39.32 
 
 		 464 aa  253  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2515  tRNA modification GTPase TrmE  36.52 
 
 		 464 aa  252  9.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4138  tRNA modification GTPase TrmE  39.36 
 
 		 486 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.619376  normal  0.415942 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2853  tRNA modification GTPase TrmE  46.48 
 
 		 419 aa  252  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0789426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>