114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4933 on replicon NC_013442
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  36.32 
 
 		 1575 aa  799    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  35.53 
 
 		 1925 aa  819    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  36.94 
 
 		 1606 aa  828    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  100 
 
 		 1956 aa  3993    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  31.94 
 
 		 1693 aa  631  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1748 aa  615  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  30.74 
 
 		 1697 aa  613  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  31.49 
 
 		 1703 aa  612  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  29.83 
 
 		 2098 aa  612  1e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  31.04 
 
 		 1701 aa  608  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  30.75 
 
 		 1702 aa  592  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  31.39 
 
 		 1697 aa  580  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 1516 aa  577  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  29.31 
 
 		 1706 aa  555  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  27.56 
 
 		 1932 aa  556  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  26.78 
 
 		 1934 aa  556  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  30.73 
 
 		 1417 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  33.17 
 
 		 1726 aa  483  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  33.74 
 
 		 1669 aa  475  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  33.84 
 
 		 1669 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  30.74 
 
 		 2077 aa  469  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 		 1674 aa  466  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  32.63 
 
 		 1700 aa  460  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  32.86 
 
 		 1642 aa  452  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 1594 aa  439  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  24.54 
 
 		 2117 aa  437  1e-121  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  32.47 
 
 		 1722 aa  410  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  35.26 
 
 		 976 aa  406  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  27.74 
 
 		 2274 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  30.83 
 
 		 1649 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  29.25 
 
 		 1211 aa  350  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  26.59 
 
 		 2570 aa  346  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  35.11 
 
 		 2005 aa  340  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  26.94 
 
 		 761 aa  186  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  30.04 
 
 		 763 aa  179  6e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  33.7 
 
 		 470 aa  166  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  25.17 
 
 		 766 aa  161  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 577 aa  122  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  30.85 
 
 		 526 aa  113  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  38 
 
 		 284 aa  107  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  28.83 
 
 		 339 aa  91.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  28.37 
 
 		 1328 aa  88.2  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  21.51 
 
 		 1379 aa  84.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  29.71 
 
 		 678 aa  77.8  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  27.85 
 
 		 254 aa  70.5  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  27.03 
 
 		 900 aa  64.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  31.61 
 
 		 669 aa  62.4  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  29.49 
 
 		 933 aa  61.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  25.27 
 
 		 341 aa  60.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  32.48 
 
 		 958 aa  59.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  24.57 
 
 		 341 aa  59.7  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  33.01 
 
 		 958 aa  59.3  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  26.4 
 
 		 595 aa  58.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  36.73 
 
 		 950 aa  57.4  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  36.43 
 
 		 572 aa  57.4  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  22.91 
 
 		 621 aa  56.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  28.04 
 
 		 1082 aa  55.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  32.18 
 
 		 894 aa  56.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  29.14 
 
 		 948 aa  55.8  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  32.17 
 
 		 468 aa  54.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  32.98 
 
 		 953 aa  54.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  29.09 
 
 		 1065 aa  53.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  29.09 
 
 		 1065 aa  53.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  34.04 
 
 		 957 aa  54.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  26.29 
 
 		 1169 aa  53.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  33.77 
 
 		 969 aa  53.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  31.58 
 
 		 840 aa  52.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  36.08 
 
 		 1147 aa  52.8  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  26.63 
 
 		 1169 aa  52.8  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  31.86 
 
 		 1057 aa  52  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49572  predicted protein  22.06 
 
 		 975 aa  52.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280952  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  28.57 
 
 		 910 aa  51.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  35 
 
 		 919 aa  50.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  33.64 
 
 		 1065 aa  50.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  32.14 
 
 		 1116 aa  51.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  27.27 
 
 		 1212 aa  50.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  35.35 
 
 		 1002 aa  50.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  27.92 
 
 		 906 aa  50.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  27.62 
 
 		 1080 aa  50.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  40.38 
 
 		 968 aa  50.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  29.63 
 
 		 922 aa  49.7  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  26.26 
 
 		 1160 aa  49.3  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  24.88 
 
 		 937 aa  49.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  32.89 
 
 		 952 aa  49.3  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  32.43 
 
 		 986 aa  49.3  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  29.03 
 
 		 1090 aa  48.9  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  25.1 
 
 		 933 aa  48.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  24.58 
 
 		 1043 aa  48.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  25.65 
 
 		 573 aa  48.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  29.31 
 
 		 774 aa  48.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4314  adenine-specific DNA methylase-like protein  33.65 
 
 		 246 aa  47.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.1972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  27.45 
 
 		 1058 aa  47.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  27.01 
 
 		 1170 aa  47.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.9 
 
 		 559 aa  48.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  40.62 
 
 		 889 aa  48.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  28.35 
 
 		 579 aa  48.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  28.69 
 
 		 941 aa  48.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  26.32 
 
 		 760 aa  47.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  34.72 
 
 		 924 aa  47  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  30 
 
 		 946 aa  47.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>