149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2306 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 555 aa  1094    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12605  lipoprotein  38.31 
 
 		 557 aa  325  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.979525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  36.96 
 
 		 548 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2585  extracellular solute-binding protein  36.71 
 
 		 548 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2278  extracellular solute-binding protein  37.29 
 
 		 549 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2325  extracellular solute-binding protein  37.29 
 
 		 549 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2317  extracellular solute-binding protein  37.29 
 
 		 549 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0985915  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  29.71 
 
 		 581 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  27.39 
 
 		 606 aa  190  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  28.47 
 
 		 606 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  27.46 
 
 		 619 aa  165  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  26.18 
 
 		 600 aa  144  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 592 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  27.08 
 
 		 592 aa  128  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0981  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 618 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  25.31 
 
 		 604 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.27 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 581 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1116  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 		 635 aa  107  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  24.77 
 
 		 611 aa  82.8  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  21.62 
 
 		 567 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  22.2 
 
 		 597 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.2 
 
 		 578 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  24.79 
 
 		 576 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  23.8 
 
 		 551 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0986  extracellular solute-binding protein family 5  40.59 
 
 		 683 aa  71.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.732347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  24.09 
 
 		 567 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  22.8 
 
 		 566 aa  70.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.71 
 
 		 579 aa  69.7  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 551 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  24.21 
 
 		 591 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 580 aa  62.8  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  21.2 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7148  extracellular solute-binding protein family 5  25.87 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  23.54 
 
 		 550 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  21.25 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5711  extracellular solute-binding protein family 5  24.66 
 
 		 550 aa  57.4  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4848  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.7 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 608 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 554 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 599 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  23.67 
 
 		 592 aa  55.5  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 		 622 aa  54.7  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  24.62 
 
 		 515 aa  54.7  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0658  extracellular solute-binding protein family 5  25.44 
 
 		 577 aa  53.9  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  24.84 
 
 		 610 aa  53.9  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  24.46 
 
 		 570 aa  53.5  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 501 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3102  extracellular solute-binding protein  20.17 
 
 		 549 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522775  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.42 
 
 		 492 aa  52  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 569 aa  52  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 529 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 501 aa  52  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  28.84 
 
 		 614 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.42 
 
 		 479 aa  52  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 595 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  23.88 
 
 		 519 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.61 
 
 		 622 aa  52  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  28.11 
 
 		 585 aa  51.2  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 525 aa  51.6  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 529 aa  51.2  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  24.69 
 
 		 562 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  23.05 
 
 		 569 aa  50.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 501 aa  50.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  27.01 
 
 		 635 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  24.37 
 
 		 587 aa  50.4  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 495 aa  50.4  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3644  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 510 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  22.29 
 
 		 508 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  24.92 
 
 		 556 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2482  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 582 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 516 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 		 517 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  23.03 
 
 		 537 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  23.59 
 
 		 590 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.77 
 
 		 542 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  20.59 
 
 		 551 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 624 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 545 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 624 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  24.93 
 
 		 559 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 624 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  31.61 
 
 		 531 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 498 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 492 aa  48.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2941  extracellular solute-binding protein family 5  21.71 
 
 		 626 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 517 aa  47.8  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  21.31 
 
 		 568 aa  47.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1821  putative peptide transport system substrate-binding protein  25.53 
 
 		 587 aa  47.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  32.54 
 
 		 517 aa  47.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  22.09 
 
 		 490 aa  47.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  22.79 
 
 		 567 aa  47.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.47 
 
 		 566 aa  47.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2731  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 		 622 aa  47.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>