More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1745 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 524 aa  1059    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  67.11 
 
 		 523 aa  730    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2141  OmpA/MotB domain-containing protein  55.08 
 
 		 520 aa  551  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0276844  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  43.27 
 
 		 231 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  43 
 
 		 466 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 230 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  44.12 
 
 		 1984 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 219 aa  85.9  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 219 aa  85.1  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  37.39 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  31.43 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  30.68 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  39.31 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  44.76 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  40.38 
 
 		 669 aa  83.6  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 454 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  45.63 
 
 		 2000 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 242 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 187 aa  82  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  44.44 
 
 		 210 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  42.31 
 
 		 219 aa  82.4  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  41.35 
 
 		 214 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  44.44 
 
 		 210 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  39.6 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  36.51 
 
 		 498 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  40.38 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  39.6 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.35 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 222 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 221 aa  79.7  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 		 217 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  40.38 
 
 		 607 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 227 aa  78.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  45.71 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  37.38 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  37.62 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  45.71 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  37.19 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.7 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  41.59 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  38.74 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  40 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  41.51 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.78 
 
 		 542 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  40.87 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.71 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  44 
 
 		 186 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  37 
 
 		 376 aa  76.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.81 
 
 		 407 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 543 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 375 aa  76.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 244 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  40 
 
 		 294 aa  75.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  34.71 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  40.87 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  38.32 
 
 		 640 aa  75.1  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  41.76 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2804  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3118  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.33 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  52.86 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  41.35 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  39.05 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  40 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  41.58 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  40 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  41.58 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  31.35 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>