101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5966 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  100 
 
 		 390 aa  764    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  76.9 
 
 		 411 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  43.15 
 
 		 311 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  39.04 
 
 		 341 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  44.65 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  47.41 
 
 		 315 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  33.97 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  33.01 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  33.01 
 
 		 361 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  32.58 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  32.58 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  32.58 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  32.58 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  32.58 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  32.58 
 
 		 337 aa  144  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  32.58 
 
 		 337 aa  144  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  32.58 
 
 		 337 aa  144  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  32.56 
 
 		 337 aa  143  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  31.21 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  32.34 
 
 		 339 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  32.34 
 
 		 339 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  33.45 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  34.74 
 
 		 366 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  33.93 
 
 		 332 aa  136  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  32 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  32.5 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  32.98 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  31.12 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  30.03 
 
 		 342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  31.23 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  31.23 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  31.23 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  31.23 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  30.07 
 
 		 346 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  32.21 
 
 		 328 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  28.14 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  30.36 
 
 		 347 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  29.53 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  27.61 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  32.97 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  30.47 
 
 		 367 aa  96.3  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  33.99 
 
 		 343 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  33.11 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 307 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  25.27 
 
 		 289 aa  89  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  29.35 
 
 		 307 aa  87  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  31.43 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  27.69 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  28.57 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  25.78 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  29.5 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  26.3 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  26.35 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  26.32 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  23.45 
 
 		 525 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  24.14 
 
 		 538 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  23.45 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  21.41 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  23.92 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  28.85 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0986  ribonuclease BN  27.01 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  25.37 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  25.44 
 
 		 546 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  28.4 
 
 		 321 aa  53.5  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  26.67 
 
 		 294 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0817  ribonuclease BN  25.56 
 
 		 315 aa  53.1  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  21.89 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  23.71 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  25.78 
 
 		 311 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  23.91 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  23.91 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  23.91 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  25.84 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  23.05 
 
 		 350 aa  50.1  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  25.09 
 
 		 347 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  26.05 
 
 		 307 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  24.47 
 
 		 299 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  27.24 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  22.81 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  24.75 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  22.13 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  25.86 
 
 		 447 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  23.57 
 
 		 433 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  26.99 
 
 		 444 aa  46.6  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  27.9 
 
 		 375 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  24.58 
 
 		 336 aa  46.6  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  26.62 
 
 		 330 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  25 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20430  predicted membrane protein  23.7 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  24.67 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  22.57 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  24.34 
 
 		 386 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  23.37 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  25.88 
 
 		 311 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  27.51 
 
 		 324 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  28.23 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5288  ribonuclease BN  22.79 
 
 		 316 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1463  serum resistance locus BrkB-like protein  27.42 
 
 		 304 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01651  serum resistance locus BrkB-like protein  27.42 
 
 		 304 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.596268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  24.32 
 
 		 304 aa  43.1  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>