102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1458 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1458  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  84.54 
 
 		 508 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  84.54 
 
 		 508 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  63.83 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  45.45 
 
 		 377 aa  61.2  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  45.07 
 
 		 391 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  50.88 
 
 		 378 aa  55.1  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0388  hypothetical protein  37.25 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  61.22 
 
 		 492 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  40.51 
 
 		 390 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  43.86 
 
 		 503 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  61.7 
 
 		 377 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  40.28 
 
 		 442 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  40.28 
 
 		 393 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  44.26 
 
 		 373 aa  52.8  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  33.75 
 
 		 423 aa  52  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  43.75 
 
 		 391 aa  51.6  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  35.78 
 
 		 433 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  40.98 
 
 		 325 aa  51.6  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  37.5 
 
 		 392 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  45.61 
 
 		 506 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  48.21 
 
 		 354 aa  50.1  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  48.21 
 
 		 353 aa  50.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  41.27 
 
 		 378 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  36.62 
 
 		 413 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1565  phage integrase  34.57 
 
 		 416 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1117  phage integrase  46.38 
 
 		 369 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.343038  decreased coverage  0.00190839 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  31.25 
 
 		 370 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  32.08 
 
 		 376 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  49.12 
 
 		 352 aa  49.7  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  40.3 
 
 		 396 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  34.48 
 
 		 387 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  32.39 
 
 		 121 aa  49.3  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  33.8 
 
 		 370 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  31.48 
 
 		 376 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  43.64 
 
 		 383 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  49.06 
 
 		 385 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  48.28 
 
 		 387 aa  49.3  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  31.13 
 
 		 376 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  31.13 
 
 		 376 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  40.98 
 
 		 378 aa  48.5  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  47.27 
 
 		 354 aa  48.5  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  48.28 
 
 		 355 aa  48.1  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  45.61 
 
 		 353 aa  47.8  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  40.74 
 
 		 477 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  47.27 
 
 		 310 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  38.1 
 
 		 435 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  43.55 
 
 		 386 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.27 
 
 		 374 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.27 
 
 		 374 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  49.06 
 
 		 367 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  45.65 
 
 		 391 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  42 
 
 		 414 aa  47  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  37.04 
 
 		 365 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  44.64 
 
 		 354 aa  45.8  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2157  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00218836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2095  phage integrase  40 
 
 		 120 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2312  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.430324  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  44.64 
 
 		 354 aa  45.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  44.64 
 
 		 354 aa  45.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  35.71 
 
 		 369 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2337  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  39.13 
 
 		 389 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  41.1 
 
 		 494 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  32.74 
 
 		 397 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  32.79 
 
 		 369 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  39.66 
 
 		 381 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  33.93 
 
 		 369 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  46.27 
 
 		 463 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  40.35 
 
 		 379 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2236  integrase family protein  51.22 
 
 		 340 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0483412  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  45.45 
 
 		 357 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  33.93 
 
 		 404 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  58.97 
 
 		 429 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1646  integrase family protein  47.92 
 
 		 330 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  45.61 
 
 		 391 aa  43.5  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  51.06 
 
 		 390 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  51.35 
 
 		 372 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  51.35 
 
 		 519 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  31.82 
 
 		 381 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  44.19 
 
 		 388 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  32.29 
 
 		 368 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3743  integrase family protein  44.23 
 
 		 445 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3794  integrase family protein  44.23 
 
 		 445 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0397442 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  30.77 
 
 		 381 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  45.45 
 
 		 377 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  36.99 
 
 		 407 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  40 
 
 		 416 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1131  Integrase  50.98 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.127877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.47 
 
 		 330 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  32.79 
 
 		 305 aa  42.4  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  46.3 
 
 		 353 aa  42.4  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  31.82 
 
 		 209 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  42.31 
 
 		 469 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0994  site-specific tyrosine recombinase XerS  36.05 
 
 		 359 aa  42  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000205377  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  40.68 
 
 		 416 aa  42  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  40 
 
 		 301 aa  42  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  36.92 
 
 		 400 aa  41.6  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1208  integrase family protein  43.1 
 
 		 363 aa  41.6  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  34.29 
 
 		 392 aa  41.6  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>