219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0389 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  100 
 
 		 1026 aa  1986    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 1132 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  32.9 
 
 		 817 aa  298  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  33.62 
 
 		 1281 aa  298  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  33.58 
 
 		 1560 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  32.62 
 
 		 950 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  34.1 
 
 		 950 aa  280  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  33.8 
 
 		 669 aa  280  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  36.56 
 
 		 973 aa  280  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  35.47 
 
 		 801 aa  280  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  32.75 
 
 		 1092 aa  279  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.66 
 
 		 1049 aa  278  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  33.02 
 
 		 683 aa  275  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  37.06 
 
 		 769 aa  275  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  32 
 
 		 697 aa  275  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 		 1282 aa  273  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 1119 aa  272  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  32.76 
 
 		 1004 aa  271  7e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  31.91 
 
 		 991 aa  268  5.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  32.5 
 
 		 905 aa  267  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  32.75 
 
 		 807 aa  267  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  32.58 
 
 		 821 aa  266  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.17 
 
 		 957 aa  264  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  32.91 
 
 		 854 aa  262  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  33.28 
 
 		 735 aa  259  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 1077 aa  258  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  38.81 
 
 		 836 aa  257  8e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  31.71 
 
 		 879 aa  256  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 		 1268 aa  257  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  32.04 
 
 		 1148 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  46.06 
 
 		 763 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  33.33 
 
 		 1023 aa  255  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  32.51 
 
 		 1051 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  42.26 
 
 		 797 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  33.91 
 
 		 818 aa  254  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  31.16 
 
 		 637 aa  254  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  31.98 
 
 		 795 aa  251  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  29.47 
 
 		 839 aa  249  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  32.21 
 
 		 1164 aa  249  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  33.84 
 
 		 974 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 805 aa  246  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  31.79 
 
 		 1060 aa  246  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  31.91 
 
 		 996 aa  241  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  42.11 
 
 		 854 aa  241  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 1182 aa  240  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  31.29 
 
 		 841 aa  235  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  32.13 
 
 		 843 aa  230  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  30.73 
 
 		 965 aa  226  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  44.72 
 
 		 829 aa  225  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  33.69 
 
 		 769 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  30.19 
 
 		 1031 aa  221  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  30.39 
 
 		 1022 aa  210  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  30.56 
 
 		 817 aa  203  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  42.72 
 
 		 687 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  31.45 
 
 		 1152 aa  197  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  35.48 
 
 		 895 aa  195  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  28.98 
 
 		 832 aa  194  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 860 aa  186  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  37.26 
 
 		 1047 aa  185  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  36.68 
 
 		 1310 aa  181  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 851 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 851 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 851 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  30.63 
 
 		 876 aa  178  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  31.02 
 
 		 798 aa  177  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.55 
 
 		 803 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  29.55 
 
 		 863 aa  172  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  30.69 
 
 		 839 aa  171  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  40.68 
 
 		 670 aa  170  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  39.46 
 
 		 733 aa  169  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  28.35 
 
 		 1000 aa  168  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  33.33 
 
 		 1402 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 		 1435 aa  165  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  36.2 
 
 		 799 aa  159  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 1034 aa  156  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  28.28 
 
 		 794 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  42.44 
 
 		 769 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  36.61 
 
 		 1076 aa  154  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  41.4 
 
 		 484 aa  151  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  28.32 
 
 		 814 aa  144  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  30.85 
 
 		 764 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  36.99 
 
 		 516 aa  138  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  37.9 
 
 		 832 aa  137  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  36.24 
 
 		 436 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  37.2 
 
 		 630 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  33.86 
 
 		 575 aa  115  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 412 aa  115  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  31.34 
 
 		 600 aa  110  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  34.03 
 
 		 465 aa  109  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  37.42 
 
 		 539 aa  95.9  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 453 aa  95.9  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 		 485 aa  94.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  30.94 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  29.36 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0512  histidine kinase  25.91 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 509 aa  62  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 		 661 aa  57  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  37.5 
 
 		 950 aa  56.6  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.16 
 
 		 3427 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 883 aa  56.2  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>