91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_5014 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_5014  sterol desaturase-like protein  100 
 
 
230 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1699  sterol desaturase family protein  38.78 
 
 
196 aa  149  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.844125  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1488  fatty acid hydroxylase  39.77 
 
 
231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568753 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1382  fatty acid hydroxylase  38.6 
 
 
227 aa  128  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  27.94 
 
 
262 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1692  fatty acid hydroxylase  24.75 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  23.18 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  25.62 
 
 
273 aa  62.8  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6297  predicted protein  29.93 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711941  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  24.65 
 
 
281 aa  59.3  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  24.62 
 
 
253 aa  58.9  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  26.67 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  27.27 
 
 
271 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  23.13 
 
 
267 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  24.72 
 
 
287 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  24.32 
 
 
288 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  24.32 
 
 
288 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  24.32 
 
 
288 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  23.78 
 
 
288 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  23.53 
 
 
287 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  21.52 
 
 
304 aa  52  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  24.16 
 
 
287 aa  52  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  23.9 
 
 
273 aa  52  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1631  hypothetical protein  24.47 
 
 
312 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.305969 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0776  sterol desaturase family protein  24.16 
 
 
314 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  28.97 
 
 
413 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3807  sterol desaturase family protein  23.03 
 
 
287 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  25.17 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  19.31 
 
 
256 aa  49.3  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  22.7 
 
 
287 aa  49.3  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  21.92 
 
 
264 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  24.58 
 
 
271 aa  48.9  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  23.29 
 
 
267 aa  48.9  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  27.61 
 
 
292 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  24.49 
 
 
276 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  25.26 
 
 
285 aa  48.5  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  21.86 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  25.38 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  22.12 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  23.08 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  21.23 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  19.81 
 
 
295 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  26.15 
 
 
337 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  24.24 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  25.12 
 
 
324 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  23.74 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  23.49 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  24.26 
 
 
259 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  20.6 
 
 
310 aa  46.6  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  23.81 
 
 
270 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  23.57 
 
 
293 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  24.86 
 
 
292 aa  45.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  22.03 
 
 
304 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  22.03 
 
 
304 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  22.03 
 
 
304 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2297  fatty acid hydroxylase  30.84 
 
 
344 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  21.38 
 
 
330 aa  45.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  21.38 
 
 
330 aa  45.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  19.5 
 
 
272 aa  45.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  30.5 
 
 
274 aa  45.4  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  24.46 
 
 
279 aa  45.4  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  24.32 
 
 
272 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  25.17 
 
 
304 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18900  predicted protein  22.97 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  22.28 
 
 
319 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0600  sterol desaturase-like  26.81 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  22.1 
 
 
287 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  24.16 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  25.69 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  27.06 
 
 
426 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  20.85 
 
 
308 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  25.69 
 
 
270 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  27.86 
 
 
270 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4620  fatty acid hydroxylase  25.66 
 
 
288 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  25.29 
 
 
315 aa  43.1  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  21.61 
 
 
304 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  27.56 
 
 
282 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  24.66 
 
 
400 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37371  predicted protein  27.46 
 
 
288 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2491  fatty acid hydroxylase  30.84 
 
 
344 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169325  normal  0.90493 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  23.53 
 
 
289 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  24.11 
 
 
304 aa  42.4  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  20.98 
 
 
328 aa  42.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  27.46 
 
 
321 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0146  fatty acid hydroxylase  28.89 
 
 
257 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113209 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14208  predicted protein  23.61 
 
 
249 aa  42.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  20.82 
 
 
282 aa  42  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  22.7 
 
 
270 aa  42  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  22.7 
 
 
291 aa  42  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  26.76 
 
 
328 aa  41.6  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  23.94 
 
 
301 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>