103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3033 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_3033  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 468 aa  974    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 496 aa  69.3  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  23.14 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  25.81 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  26.54 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  29.84 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1968  Radical SAM domain protein  29.57 
 
 		 458 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  24.1 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 359 aa  57  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  25.77 
 
 		 335 aa  57  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  28.41 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  24.74 
 
 		 873 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  25.54 
 
 		 447 aa  53.9  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 349 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  31.93 
 
 		 346 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  28 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  30.97 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  24.6 
 
 		 366 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.54 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2071  radical SAM family protein  26.56 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00377387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  30.26 
 
 		 390 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 335 aa  51.6  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 418 aa  51.2  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  24 
 
 		 341 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 391 aa  50.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 389 aa  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 465 aa  50.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  24.86 
 
 		 330 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  29.67 
 
 		 311 aa  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 380 aa  50.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 347 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  23.23 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  31.97 
 
 		 382 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  24.86 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2372  radical SAM domain-containing protein  25.63 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  27.7 
 
 		 326 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  27.63 
 
 		 332 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 355 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  23.24 
 
 		 358 aa  49.3  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 399 aa  49.3  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 		 351 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 		 372 aa  48.5  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0197  radical SAM family protein  22.04 
 
 		 367 aa  47.8  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 		 474 aa  47.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 421 aa  47  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  27.39 
 
 		 441 aa  47  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  21.35 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  25.12 
 
 		 374 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  30.28 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  24.06 
 
 		 361 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  24.06 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  22.28 
 
 		 446 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.41 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2633  Radical SAM domain protein  39.36 
 
 		 503 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.67 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  29.1 
 
 		 769 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.37 
 
 		 394 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4990  radical SAM family protein  26.02 
 
 		 386 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.396764  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1126  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.53 
 
 		 225 aa  45.1  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0726  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.58 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130382 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  27.4 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.67 
 
 		 326 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  22.95 
 
 		 422 aa  45.1  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 		 480 aa  45.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  21.65 
 
 		 329 aa  45.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  26.28 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 516 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 422 aa  44.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 351 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  26.95 
 
 		 368 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  28.23 
 
 		 359 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 		 460 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.87 
 
 		 399 aa  44.3  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.76 
 
 		 326 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  26.7 
 
 		 376 aa  43.9  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 367 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 429 aa  43.9  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26.06 
 
 		 349 aa  43.9  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 358 aa  43.9  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0928  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 355 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0991666  normal  0.304718 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  30.13 
 
 		 471 aa  43.9  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  31.08 
 
 		 331 aa  43.5  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  28.36 
 
 		 406 aa  43.5  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 427 aa  43.5  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 445 aa  43.5  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>