More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0487 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 433 aa  879    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 446 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.62 
 
 		 496 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 439 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  30.03 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  26.3 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 438 aa  127  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.97 
 
 		 486 aa  126  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.48 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 419 aa  124  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.96 
 
 		 439 aa  123  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.96 
 
 		 439 aa  123  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  31.96 
 
 		 425 aa  122  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  29 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 449 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 448 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 435 aa  117  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2064  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 439 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 408 aa  112  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  26.63 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  29.53 
 
 		 442 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 440 aa  110  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 444 aa  110  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 443 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5198  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 		 442 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.06332 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 444 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 477 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 		 419 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  28.66 
 
 		 447 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  25.3 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.02 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 451 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 536 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.02 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 477 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.87 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 498 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6371  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.970426 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  23.78 
 
 		 422 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4399  extracellular solute-binding protein family 1  21.71 
 
 		 455 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0609802  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.68 
 
 		 423 aa  97.1  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 413 aa  97.4  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5638  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 443 aa  97.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 439 aa  96.7  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 421 aa  96.7  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 410 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 424 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  22.45 
 
 		 421 aa  94  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0271  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1045  hypothetical protein  48.42 
 
 		 99 aa  90.9  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.694551  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 386 aa  90.1  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1213  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 497 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.07 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.08 
 
 		 426 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.08 
 
 		 426 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.08 
 
 		 426 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.08 
 
 		 426 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1739  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.77 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0230  putative transporter periplasmic binding protein  24.77 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1212  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 497 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1283  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 497 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3495  extracellular solute-binding protein, family 1  22.67 
 
 		 487 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 435 aa  86.7  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 423 aa  86.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3021  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1357  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000953949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1533  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.219593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3164  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.625995  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>