More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_585 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  100 
 
 		 169 aa  349  1e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  89.35 
 
 		 171 aa  319  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  89.35 
 
 		 171 aa  319  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  88.17 
 
 		 169 aa  311  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  58.82 
 
 		 176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  54.32 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  48.52 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  46.75 
 
 		 169 aa  174  7e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  44.97 
 
 		 174 aa  166  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  44.97 
 
 		 169 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  46.15 
 
 		 169 aa  165  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  45.78 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  49.11 
 
 		 169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  45.18 
 
 		 166 aa  160  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  49.41 
 
 		 170 aa  155  3e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  44.79 
 
 		 169 aa  152  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  46.75 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  44.97 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  42.01 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  40.24 
 
 		 173 aa  147  7e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  42.01 
 
 		 173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  41.42 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  43.79 
 
 		 169 aa  141  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  38.24 
 
 		 201 aa  134  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  38.69 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  39.58 
 
 		 171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  38.82 
 
 		 274 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  33.33 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  36.47 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  37.8 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  35.09 
 
 		 197 aa  111  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  35.33 
 
 		 167 aa  108  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  35.8 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  42.04 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  34.1 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  37.04 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  34.87 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  31.38 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  33.75 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  32.56 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  34.71 
 
 		 170 aa  98.2  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  32.98 
 
 		 184 aa  97.8  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  36.36 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  33.15 
 
 		 191 aa  95.5  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  35.71 
 
 		 194 aa  95.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  32.91 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  33.15 
 
 		 214 aa  95.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  34.81 
 
 		 167 aa  94.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  33.33 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  34.39 
 
 		 176 aa  92  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.41 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  35.88 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.91 
 
 		 186 aa  92.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  32.18 
 
 		 172 aa  92  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  35.06 
 
 		 178 aa  92  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  31.61 
 
 		 172 aa  90.9  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  35.37 
 
 		 192 aa  90.9  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  34 
 
 		 173 aa  90.5  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  35.62 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  34.71 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  31.71 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  33.53 
 
 		 189 aa  89.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  34.15 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.57 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  31.06 
 
 		 180 aa  88.6  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  32.95 
 
 		 189 aa  88.6  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  33.55 
 
 		 170 aa  88.2  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  33.9 
 
 		 176 aa  87.8  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  35.29 
 
 		 191 aa  87  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  30.81 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  29.38 
 
 		 188 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  28.82 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  36.54 
 
 		 174 aa  85.5  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  31.76 
 
 		 176 aa  84  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  28.74 
 
 		 176 aa  84  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  29.78 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  31.48 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  33.93 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  33.33 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  33.33 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.57 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  29.94 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  30.82 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  32.62 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  34.39 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  29.94 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  33.93 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  29.71 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  30.59 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  34.36 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  31.97 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  32.91 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  30.49 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  28.33 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  28.22 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  32.75 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  28.27 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  28.27 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  39.74 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  38.46 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>