173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2611 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2611  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
223 aa  447  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000894277  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1171  cyclic nucleotide-binding protein  24.63 
 
 
226 aa  82  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00521884  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.81 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.68 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.14 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.06 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.76 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.38 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.27 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.24 
 
 
234 aa  59.7  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.16 
 
 
224 aa  58.9  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.4 
 
 
243 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.4 
 
 
243 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.77 
 
 
225 aa  58.5  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_002950  PG1053  transcriptional regulator, putative  25.83 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0216294 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1827  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.18 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.88 
 
 
243 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0984  Crp-like transcriptional regulator  23.3 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.72 
 
 
219 aa  55.5  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.7 
 
 
229 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.7 
 
 
229 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.7 
 
 
230 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.7 
 
 
230 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  25.7 
 
 
229 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  25.7 
 
 
230 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  25.7 
 
 
230 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  22.51 
 
 
352 aa  55.1  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.81 
 
 
227 aa  55.1  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03090  cAMP-binding protein  35.71 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0333204  hitchhiker  1.31136e-22 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.7 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2709  transcriptional activator FtrB  29.03 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0829617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.96 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000947161  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  24.88 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0199  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0681  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.88 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0670228  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1785  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.38 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0232074  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.92 
 
 
232 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.58 
 
 
352 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.26 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.58 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3583  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.34 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.51 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.99 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990851  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4660  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.34 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1303  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.02 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2531  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.76 
 
 
226 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.62 
 
 
239 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.43 
 
 
227 aa  52.4  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0291  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.97 
 
 
227 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1379  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.04 
 
 
245 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231738  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1162  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.11 
 
 
220 aa  52  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.76 
 
 
226 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.35 
 
 
229 aa  51.6  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.96 
 
 
229 aa  51.6  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01902  putative transcription regulator protein  28.43 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2635  cyclic nucleotide-binding protein  25.71 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1578  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.54 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1297  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.73 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.93 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.74 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.6 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.04 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3189  transcriptional regulator  23.23 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4557  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.79 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  hitchhiker  0.000201157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.54 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2109  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.77 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170093  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.41 
 
 
230 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0390  cyclic nucleotide-binding protein  21.99 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
236 aa  48.9  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1573  Crp family transcriptional regulator  20 
 
 
283 aa  48.5  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
234 aa  48.5  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.51 
 
 
252 aa  48.5  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7045  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.53 
 
 
237 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  0.0108856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0027  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
237 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1275  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.33 
 
 
230 aa  48.5  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03580  putative transcriptional regulator  25.28 
 
 
228 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000980911  hitchhiker  0.0000000000977836 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  21.39 
 
 
221 aa  48.1  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0034  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 
219 aa  48.5  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000350916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.58 
 
 
222 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.24 
 
 
200 aa  48.1  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0478  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  28.31 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.31 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.07605e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2978  Crp/FNR family transcriptional regulator  20 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1459  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.26 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.351279  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  22.44 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0436  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.44 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000632498  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.65 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  24.85 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>