133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2165 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2165  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 481 aa  983    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1672  extracellular solute-binding protein family 1  60.08 
 
 		 459 aa  570  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0497  extracellular solute-binding protein family 1  60.93 
 
 		 459 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.128275 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1089  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 497 aa  103  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2128  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  21.73 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  22.47 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  20.8 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.03 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  21.79 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3027  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.56 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  22.99 
 
 		 483 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  23.06 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  22.13 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  21.28 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  21.28 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  20.85 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  21.4 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  21.28 
 
 		 455 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  21.32 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3152  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 970 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  18.41 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.46 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.65 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.98 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  21.95 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7590  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  19.84 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  21.35 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  22.66 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2313  extracellular solute-binding protein  21.69 
 
 		 901 aa  57  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  20.33 
 
 		 416 aa  57  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 414 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  20.15 
 
 		 442 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 480 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  21.84 
 
 		 436 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  20.61 
 
 		 433 aa  54.7  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 		 432 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 425 aa  54.7  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 412 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  27.83 
 
 		 418 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2315  extracellular solute-binding protein  21.98 
 
 		 925 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  21.16 
 
 		 424 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  21.3 
 
 		 445 aa  53.9  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  21.26 
 
 		 431 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.35 
 
 		 434 aa  53.9  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 432 aa  53.9  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  20.16 
 
 		 422 aa  53.9  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0637  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 425 aa  53.5  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  24.49 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  21.76 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  21.76 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3553  hypothetical protein  21.72 
 
 		 427 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 421 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 		 420 aa  51.2  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  22.26 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  21.17 
 
 		 464 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.42 
 
 		 407 aa  50.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 		 420 aa  50.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  20.23 
 
 		 510 aa  50.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4883  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.08 
 
 		 417 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134037  normal  0.0630481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 		 422 aa  50.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  21.82 
 
 		 439 aa  50.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 412 aa  50.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  21.33 
 
 		 451 aa  50.1  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  21.64 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  21.15 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  21.37 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  22.51 
 
 		 415 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  22.9 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  19.15 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  19.22 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 419 aa  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  19.44 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5331  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.28 
 
 		 431 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3703  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 466 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 395 aa  47.4  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  20.31 
 
 		 420 aa  47  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>