60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2128 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2128  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 460 aa  944    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2165  extracellular solute-binding protein family 1  21.76 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0497  extracellular solute-binding protein family 1  19.25 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.128275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1672  extracellular solute-binding protein family 1  19.8 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  21.62 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.66 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  22.07 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.13 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.6 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  21.14 
 
 		 447 aa  57  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1089  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 		 497 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 395 aa  54.3  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.36 
 
 		 366 aa  53.9  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  23.11 
 
 		 421 aa  53.5  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  20.5 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  20.05 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  20.08 
 
 		 449 aa  51.2  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 399 aa  51.2  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  18.86 
 
 		 442 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  19.13 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  21.36 
 
 		 435 aa  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  19.26 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 414 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  20.5 
 
 		 503 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0694  extracellular solute-binding protein family 1  20.72 
 
 		 415 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  19.92 
 
 		 467 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  21.47 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  22.5 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  22.5 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  19.67 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  22.46 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  21.88 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  19.55 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2185  putative lipoprotein  25.42 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3553  hypothetical protein  23.44 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  19.13 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2195  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  21.72 
 
 		 447 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  19.9 
 
 		 436 aa  44.3  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.49 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.49 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  19.35 
 
 		 480 aa  43.9  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.71 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  19.88 
 
 		 488 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 445 aa  43.9  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  17.83 
 
 		 452 aa  43.5  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 		 420 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  20.83 
 
 		 438 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 428 aa  43.1  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  18.25 
 
 		 441 aa  43.1  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>