More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2193 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2193  histidine kinase  100 
 
 		 1035 aa  2133    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0609  histidine kinase  27.38 
 
 		 1016 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2334  histidine kinase  24.27 
 
 		 1052 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  24.76 
 
 		 1340 aa  144  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  22.76 
 
 		 1070 aa  124  8e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  25.23 
 
 		 1374 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  23.24 
 
 		 1070 aa  120  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  22.97 
 
 		 1086 aa  117  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  22.26 
 
 		 1414 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  21.97 
 
 		 1346 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  23.68 
 
 		 1093 aa  114  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  24.73 
 
 		 1344 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  23.95 
 
 		 1074 aa  109  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  21.88 
 
 		 1526 aa  104  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  23.27 
 
 		 1298 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  21.18 
 
 		 1342 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  24.69 
 
 		 1374 aa  102  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  21.1 
 
 		 1407 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  24.76 
 
 		 1075 aa  102  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  21.6 
 
 		 1404 aa  99.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  22.96 
 
 		 1373 aa  99.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  21.26 
 
 		 1378 aa  99  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  22.3 
 
 		 1311 aa  98.6  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  21.78 
 
 		 1397 aa  98.2  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  24.48 
 
 		 1355 aa  98.2  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  24.59 
 
 		 1175 aa  97.8  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  21.14 
 
 		 1334 aa  96.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  22.8 
 
 		 1118 aa  97.1  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  23.64 
 
 		 1384 aa  95.1  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  21.41 
 
 		 1343 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  22.51 
 
 		 1185 aa  93.2  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  20.91 
 
 		 1363 aa  90.9  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  26.82 
 
 		 970 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  22.1 
 
 		 1396 aa  90.9  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  23.06 
 
 		 1355 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 		 1258 aa  89.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  22.1 
 
 		 1373 aa  89.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  22.05 
 
 		 1370 aa  89  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  24.25 
 
 		 1105 aa  88.2  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  23.54 
 
 		 1114 aa  88.2  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  25.64 
 
 		 594 aa  87.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 		 1211 aa  86.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  22.82 
 
 		 1278 aa  87  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  21.5 
 
 		 985 aa  85.5  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01692  histidine kinase-response regulator hybrid protein  21.04 
 
 		 921 aa  85.5  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.803557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  23.79 
 
 		 565 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  23.59 
 
 		 1327 aa  83.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  28.89 
 
 		 998 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.67 
 
 		 1498 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0725  histidine kinase  21.69 
 
 		 1036 aa  83.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  20.11 
 
 		 1084 aa  82.8  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0190  histidine kinase  25.25 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.393808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  21.72 
 
 		 1400 aa  82.8  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.9 
 
 		 1172 aa  82.8  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.49 
 
 		 649 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.512504  normal  0.0507183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 		 1352 aa  82.4  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.28 
 
 		 663 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  22.64 
 
 		 1335 aa  82  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.73 
 
 		 1194 aa  81.3  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 		 767 aa  81.3  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  22.48 
 
 		 1374 aa  80.9  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 		 909 aa  80.9  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1954  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  27.57 
 
 		 657 aa  80.9  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  24.18 
 
 		 577 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  21.92 
 
 		 1024 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0244  two component system histidine kinase  27.16 
 
 		 657 aa  80.1  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 395 aa  79.7  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003464  signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 573 aa  78.6  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  26.69 
 
 		 833 aa  78.6  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  26.09 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  20.83 
 
 		 1347 aa  78.2  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  26.09 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  21.2 
 
 		 1418 aa  78.2  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0605  histidine kinase  22.39 
 
 		 1190 aa  77.8  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0688  histidine kinase/response regulator hybrid protein  22.39 
 
 		 1179 aa  77.4  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 490 aa  77.4  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 1453 aa  77.8  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 		 1169 aa  77.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 754 aa  77.4  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.36 
 
 		 1030 aa  77.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  26.74 
 
 		 1169 aa  77.4  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.5 
 
 		 645 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 510 aa  77  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.91 
 
 		 1037 aa  77  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.96 
 
 		 856 aa  76.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.28 
 
 		 1142 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  22.84 
 
 		 1250 aa  77  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 		 893 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 977 aa  75.9  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 		 1326 aa  76.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.99 
 
 		 1195 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  26.4 
 
 		 925 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6022  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  29.2 
 
 		 596 aa  76.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.277911  normal  0.668143 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.85 
 
 		 1127 aa  76.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.26 
 
 		 854 aa  75.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 785 aa  75.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.08 
 
 		 919 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.55 
 
 		 1163 aa  75.5  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.99 
 
 		 1038 aa  75.5  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>