118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0389 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0568  hypothetical protein  79.44 
 
 		 442 aa  674    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0478  hypothetical protein  84.51 
 
 		 436 aa  739    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0389  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  880    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.478293  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0473  hypothetical protein  78.51 
 
 		 442 aa  684    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.796891  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0146  hypothetical protein  62.61 
 
 		 439 aa  528  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0669  hypothetical protein  61.05 
 
 		 439 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1154  hypothetical protein  37.17 
 
 		 490 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0371  hypothetical protein  38.63 
 
 		 457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.294814  normal  0.553229 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0418  membrane-fusion protein  38.91 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3181  hypothetical protein  35.68 
 
 		 446 aa  246  8e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1673  hypothetical protein  33.78 
 
 		 446 aa  244  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27195  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2055  hypothetical protein  38.82 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  35.81 
 
 		 449 aa  236  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3073  hypothetical protein  37.1 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0299  hypothetical protein  31.61 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.251177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0680  hypothetical protein  37.3 
 
 		 451 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0908  hypothetical protein  37 
 
 		 451 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3740  HlyD family secretion protein  34.28 
 
 		 441 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0926  GAF domain-containing protein  28.25 
 
 		 614 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  26.06 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2177  GAF domain-containing protein  29.08 
 
 		 611 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266529 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1279  HlyD family secretion protein  29.95 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  25.39 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1408  membrane-fusion protein-like  26.59 
 
 		 631 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.382309  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2359  putative phytochrome sensor protein  25.74 
 
 		 627 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3236  GAF domain-containing protein  24.49 
 
 		 578 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3968  hypothetical protein  26.74 
 
 		 727 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0475594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  25.57 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  23.25 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2400  GAF domain-containing protein  25.1 
 
 		 628 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  33.88 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  26.88 
 
 		 340 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  24.43 
 
 		 372 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3414  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 313 aa  51.2  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.100509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  28.88 
 
 		 380 aa  50.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.35 
 
 		 398 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.72 
 
 		 393 aa  50.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  35 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  35 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.24 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2177  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.92 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.795187  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  29.61 
 
 		 523 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  32.29 
 
 		 358 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1352  organic solvent efflux pump precursor (periplasmic linker protein component)  26.32 
 
 		 359 aa  47.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.58 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  27.94 
 
 		 373 aa  47.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  29.03 
 
 		 394 aa  47.4  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2759  hypothetical protein  24.22 
 
 		 681 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.172121  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  29.45 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.66 
 
 		 435 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  26.82 
 
 		 381 aa  47.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  28.82 
 
 		 369 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  27.78 
 
 		 334 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  28.82 
 
 		 369 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  30.82 
 
 		 369 aa  47.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.82 
 
 		 369 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  31.55 
 
 		 369 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  26.4 
 
 		 715 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  24.24 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  25.84 
 
 		 399 aa  46.6  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02838  hypothetical protein  24.16 
 
 		 378 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0618  putative phytochrome sensor protein  29.26 
 
 		 615 aa  46.6  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  26.64 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  33.6 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  24.24 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 		 308 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3738  HlyD family secretion protein  28.78 
 
 		 265 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  29.53 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  22.45 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2094  RND family efflux transporter MFP subunit  37.17 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888739  normal  0.0111779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00325  cation efflux system protein  27.49 
 
 		 244 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.888841  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.14 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.14 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5556  HlyD family secretion protein  27.31 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0679  hypothetical protein  24.26 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  24.24 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  31.33 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  23.35 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  37.78 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  29.86 
 
 		 417 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  32.33 
 
 		 299 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  22.45 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.14 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.26 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  27.03 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.41 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4325  secretion protein HlyD family protein  39.68 
 
 		 322 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107614 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0907  hypothetical protein  23.53 
 
 		 252 aa  44.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3992  RND efflux system membrane fusion protein  30.61 
 
 		 366 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.62 
 
 		 416 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1295  efflux protein  24.42 
 
 		 405 aa  44.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.47 
 
 		 419 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  28.86 
 
 		 323 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  27.8 
 
 		 418 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  25.17 
 
 		 366 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3197  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.73 
 
 		 387 aa  44.3  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.822347  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1341  putative phytochrome sensor protein  27.27 
 
 		 612 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  28.31 
 
 		 370 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  28.31 
 
 		 373 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  normal  0.257402 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>