96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2212 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  100 
 
 		 415 aa  828    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  36.63 
 
 		 465 aa  219  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0679  O-antigen polymerase  35.38 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  26.67 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  29.64 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  23.73 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  28.75 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  29.54 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  32.1 
 
 		 754 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  25.56 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  24.07 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  25.35 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  23.74 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  29.94 
 
 		 537 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  24.31 
 
 		 501 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  26.67 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  28.52 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  36.27 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  28.5 
 
 		 531 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  26.22 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  27.38 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  25.82 
 
 		 512 aa  56.2  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  26.55 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  28.08 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  28.57 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  28.57 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  28.57 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  28.83 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  23.2 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 500 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  28.64 
 
 		 607 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  29.38 
 
 		 459 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  25.95 
 
 		 464 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  28.9 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  26.34 
 
 		 785 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  29.08 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  26.64 
 
 		 540 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  29.73 
 
 		 502 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  27.59 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  20.12 
 
 		 773 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4498  O-antigen polymerase  29.7 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  29.66 
 
 		 444 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  27.59 
 
 		 492 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3781  O-antigen polymerase  29.86 
 
 		 477 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  28.22 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  26.57 
 
 		 456 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  25.76 
 
 		 459 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  27.8 
 
 		 443 aa  50.4  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  28.48 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  25.57 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02935  hypothetical protein  25.15 
 
 		 408 aa  50.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3885  O-antigen polymerase  25.95 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.722344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  30.1 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2886  O-antigen ligase-like  21.88 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000199013  normal  0.062273 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  25 
 
 		 468 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0122  hypothetical protein  27.67 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0117  hypothetical protein  27.67 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.706164  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1394  O-antigen polymerase  26.59 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0739482 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  28.45 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  23.2 
 
 		 464 aa  47  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0583  O-antigen polymerase  22.04 
 
 		 449 aa  46.6  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  32.52 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0657  O-antigen polymerase  39.51 
 
 		 588 aa  46.2  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0056678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1940  O-antigen polymerase  35.05 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0601  hypothetical protein  25.65 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347333  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  31.61 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3347  O-antigen polymerase  29.2 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  29.29 
 
 		 668 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 930 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  22.07 
 
 		 385 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3150  O-antigen polymerase  27.5 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5593  O-antigen polymerase  26.44 
 
 		 471 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  32.26 
 
 		 517 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  41.94 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  27.4 
 
 		 560 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  35.48 
 
 		 582 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4235  O-antigen polymerase  30.86 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000407687  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5250  O-antigen polymerase  30.66 
 
 		 336 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  26.7 
 
 		 594 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  25.2 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  32.26 
 
 		 517 aa  45.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  33.64 
 
 		 440 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  26.49 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  24.34 
 
 		 495 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  26.49 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  29.03 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  36.59 
 
 		 516 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  23.22 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  28.06 
 
 		 500 aa  43.9  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3371  O-antigen polymerase  25 
 
 		 413 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  27.06 
 
 		 595 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  27.75 
 
 		 446 aa  43.1  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  26.49 
 
 		 426 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2640  O-antigen polymerase  31.58 
 
 		 434 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0149794  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  36.84 
 
 		 506 aa  43.1  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  28.92 
 
 		 451 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>