More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0893 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0893  type II and III secretion system secretin  100 
 
 		 585 aa  1179    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  53.33 
 
 		 577 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  50.95 
 
 		 554 aa  462  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3332  type II and III secretion system protein  47.78 
 
 		 614 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.449777  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  41.07 
 
 		 537 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  38.75 
 
 		 546 aa  343  5e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1135  MSHA biogenesis protein MshL  37.99 
 
 		 543 aa  335  9e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00664047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  37.14 
 
 		 572 aa  333  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03698  hypothetical protein  39.53 
 
 		 544 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  40.35 
 
 		 530 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0170  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  36.11 
 
 		 550 aa  323  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  36.7 
 
 		 549 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  36.59 
 
 		 556 aa  319  7e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0389  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  35.36 
 
 		 563 aa  318  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3751  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  35.08 
 
 		 556 aa  317  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  38.54 
 
 		 559 aa  317  6e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  35.06 
 
 		 567 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  35.69 
 
 		 569 aa  312  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  37.97 
 
 		 559 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  36.4 
 
 		 558 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0454  MSHA biogenesis protein MshL  37.32 
 
 		 561 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  37.77 
 
 		 559 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  37.38 
 
 		 609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3835  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  37.97 
 
 		 559 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0508  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  37.97 
 
 		 559 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  35.08 
 
 		 561 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  34.88 
 
 		 561 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  32.72 
 
 		 562 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  34.88 
 
 		 561 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4112  MSHA biogenesis protein MshL  36.27 
 
 		 560 aa  300  6e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  32.7 
 
 		 538 aa  287  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  27.18 
 
 		 512 aa  171  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  28.44 
 
 		 539 aa  158  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1343  Type II secretory pathway component PulD-like  25.27 
 
 		 546 aa  158  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.255385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  25.95 
 
 		 508 aa  157  4e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  26.8 
 
 		 506 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  27.13 
 
 		 563 aa  152  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  26.84 
 
 		 625 aa  150  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0549  putative Type II secretory pathway component PulD  27.04 
 
 		 581 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  27.45 
 
 		 541 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.5 
 
 		 830 aa  147  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.52 
 
 		 506 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  23.18 
 
 		 470 aa  137  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  23.18 
 
 		 470 aa  136  8e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  23.06 
 
 		 470 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0109  type II and III secretion system protein  26.58 
 
 		 547 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.379094  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0928  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.77 
 
 		 574 aa  130  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0351042  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0639  type II and III secretion system protein  23.89 
 
 		 569 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  28.27 
 
 		 733 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  23.98 
 
 		 463 aa  120  7e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  31.15 
 
 		 740 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  30.29 
 
 		 781 aa  117  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  29.37 
 
 		 738 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  29.64 
 
 		 781 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0578  type II and III secretion system protein  27.63 
 
 		 527 aa  111  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000285943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  29.48 
 
 		 736 aa  109  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  26.29 
 
 		 745 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  29.23 
 
 		 810 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  27.1 
 
 		 747 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  26.73 
 
 		 751 aa  106  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  26.91 
 
 		 819 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  27.86 
 
 		 660 aa  104  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3405  type II and III secretion system protein  30.21 
 
 		 594 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  27.61 
 
 		 710 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  26.01 
 
 		 697 aa  101  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  25.48 
 
 		 729 aa  100  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  29.81 
 
 		 716 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  24.56 
 
 		 715 aa  99.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  27.71 
 
 		 803 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  27.12 
 
 		 670 aa  99.8  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  27.38 
 
 		 686 aa  99.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  26.82 
 
 		 681 aa  99  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  24.85 
 
 		 915 aa  98.6  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  28.4 
 
 		 763 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  26.33 
 
 		 775 aa  98.6  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  27.66 
 
 		 805 aa  97.8  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  27.55 
 
 		 803 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  24.55 
 
 		 716 aa  97.1  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  29.93 
 
 		 797 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  29.13 
 
 		 776 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  25.82 
 
 		 775 aa  95.1  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  25 
 
 		 681 aa  94.7  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  24.17 
 
 		 726 aa  94.7  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  27.67 
 
 		 793 aa  94.7  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  24.57 
 
 		 712 aa  94.4  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1791  type II and III secretion system protein  24.61 
 
 		 524 aa  94  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.561359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  26.89 
 
 		 700 aa  93.6  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  26.89 
 
 		 700 aa  93.6  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1027  type II and III secretion system protein  24.76 
 
 		 552 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40658 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  26.89 
 
 		 704 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  26.98 
 
 		 702 aa  92.8  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  27.25 
 
 		 705 aa  92.8  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  26.3 
 
 		 775 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  26.33 
 
 		 703 aa  92.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  26.39 
 
 		 753 aa  92.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  26.89 
 
 		 706 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  26.33 
 
 		 704 aa  91.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  27.11 
 
 		 787 aa  91.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  29.55 
 
 		 635 aa  91.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  27.76 
 
 		 780 aa  91.3  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>