More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3225 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3225  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 
295 aa  570  1.0000000000000001e-162  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  41.72 
 
 
293 aa  172  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  47.64 
 
 
302 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  46.09 
 
 
318 aa  158  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  43.37 
 
 
336 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1511  tRNA pseudouridine synthase B  34.94 
 
 
283 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  44.76 
 
 
298 aa  157  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  43.25 
 
 
299 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11500  tRNA pseudouridine 55 synthase  41.09 
 
 
348 aa  156  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  45.93 
 
 
295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  37.79 
 
 
322 aa  155  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1311  tRNA pseudouridine synthase B  46.8 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0354136  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  41.85 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  45.1 
 
 
299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1233  tRNA pseudouridine synthase B  42.22 
 
 
313 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0870856  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1415  tRNA pseudouridine synthase B  46.09 
 
 
265 aa  152  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.334463  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  36.64 
 
 
306 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  42.59 
 
 
313 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  33.9 
 
 
301 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  41.37 
 
 
299 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  38.65 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  42.75 
 
 
327 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  34.48 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  34.48 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04550  putative tRNA pseudouridine synthase  40.83 
 
 
238 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  34.1 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  34.1 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  34.1 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  34.1 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0640  tRNA pseudouridine synthase B  43.41 
 
 
298 aa  146  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.951154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  42.79 
 
 
306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  34.1 
 
 
307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  34.1 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  34.1 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  42.65 
 
 
241 aa  145  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  40.82 
 
 
307 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  33.96 
 
 
307 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  42.79 
 
 
289 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  39.06 
 
 
293 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  39.06 
 
 
293 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  42.19 
 
 
313 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  34.48 
 
 
307 aa  142  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  42.51 
 
 
289 aa  142  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  35.22 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  37.07 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0287  tRNA pseudouridine synthase B  38.79 
 
 
367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  37.07 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  36.6 
 
 
302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  42.06 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  36.68 
 
 
305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1378  tRNA pseudouridine synthase B  37.58 
 
 
327 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  42.57 
 
 
305 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  38.1 
 
 
303 aa  138  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  35.22 
 
 
310 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1692  tRNA pseudouridine synthase B  34.39 
 
 
305 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1031  tRNA pseudouridine synthase B  39.6 
 
 
308 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  34.96 
 
 
302 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  38.04 
 
 
309 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  37.93 
 
 
311 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1021  tRNA pseudouridine synthase B  39.08 
 
 
333 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  40.08 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  35.84 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1336  tRNA pseudouridine synthase B  39.2 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671374  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  42.08 
 
 
305 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  34.21 
 
 
304 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  38.93 
 
 
315 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  34.69 
 
 
307 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  35.91 
 
 
310 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  41.29 
 
 
305 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  35.49 
 
 
310 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  42.36 
 
 
297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  34.22 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  40.32 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  37.68 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  35.15 
 
 
310 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1449  tRNA pseudouridine synthase B  38.78 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00175949  normal  0.371099 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  35.15 
 
 
310 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7739  tRNA pseudouridine synthase B  40.27 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  35.97 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  37.6 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2136  tRNA pseudouridine synthase B  35.57 
 
 
338 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0388744  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  41.01 
 
 
295 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  40.38 
 
 
314 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0676  tRNA pseudouridine synthase B  39.15 
 
 
235 aa  133  3.9999999999999996e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000650493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  34.22 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  38.01 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1232  tRNA pseudouridine synthase B  39.74 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  45.45 
 
 
303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  34.22 
 
 
305 aa  132  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  37.45 
 
 
304 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2992  tRNA pseudouridine synthase B  38.77 
 
 
321 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  38.1 
 
 
293 aa  132  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3547  tRNA pseudouridine synthase B  41.38 
 
 
228 aa  132  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  36.68 
 
 
304 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0612  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 
298 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.259864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  38.24 
 
 
306 aa  132  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  36.54 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  33.2 
 
 
308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  35.77 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  40.19 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>