205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0172 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 		 362 aa  738    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  56.88 
 
 		 351 aa  378  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  50.81 
 
 		 368 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  54.63 
 
 		 223 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  55.98 
 
 		 235 aa  249  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  52.47 
 
 		 222 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  46.4 
 
 		 220 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  30.69 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  32.05 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  42.42 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  29.4 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  34.32 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  34.67 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  33.24 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  28.96 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  29.53 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  32.49 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  32.49 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  28.86 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  31.78 
 
 		 378 aa  99.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  27.87 
 
 		 358 aa  97.1  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  33.92 
 
 		 438 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  54.44 
 
 		 820 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  48.23 
 
 		 756 aa  91.3  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  42.22 
 
 		 846 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  28 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  30.05 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  52.17 
 
 		 900 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  48.62 
 
 		 702 aa  83.6  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  52.22 
 
 		 655 aa  84  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  52.08 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  42.03 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  47.37 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  27.68 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  30.53 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  47.37 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  30.09 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  30.09 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  30.09 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  30.09 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  30.09 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  30.09 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  30.14 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2774  cellulose-binding family II  56.32 
 
 		 89 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.691497  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  27.51 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  29.65 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  49.46 
 
 		 545 aa  73.9  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  48.42 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  48 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  26.43 
 
 		 391 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  29.41 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  45.54 
 
 		 673 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  46.81 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  35.07 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  50 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  29.27 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  44.19 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  46.39 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  28.1 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  38.33 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  44.19 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  48.81 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  48.48 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  43.75 
 
 		 593 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  71.79 
 
 		 764 aa  63.2  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  28.7 
 
 		 497 aa  63.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  47.47 
 
 		 456 aa  62.8  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  24.69 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  43.33 
 
 		 649 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  42 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  43.96 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  47.06 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  26.71 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  45.65 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  51.85 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  42.57 
 
 		 474 aa  59.3  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  52.17 
 
 		 551 aa  59.3  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  45.88 
 
 		 449 aa  59.3  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.11 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  43.75 
 
 		 658 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  44.83 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  40.85 
 
 		 840 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  39 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  33.05 
 
 		 609 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  24 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  41.55 
 
 		 694 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  35.42 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  41.49 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.68 
 
 		 491 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.68 
 
 		 491 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  46.55 
 
 		 1217 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  42.57 
 
 		 847 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  45 
 
 		 441 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.22 
 
 		 481 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  26.38 
 
 		 221 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.22 
 
 		 481 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  41.49 
 
 		 678 aa  53.1  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>