More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3655 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
414 aa  850    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1999  TPR repeat-containing protein  38.51 
 
 
417 aa  246  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3274  TPR repeat-containing protein  37.63 
 
 
416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4166  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 
390 aa  179  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
878 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
635 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
635 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
611 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
3035 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.66 
 
 
565 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.65 
 
 
810 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.89 
 
 
639 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 
637 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.51 
 
 
626 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.51 
 
 
626 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 
614 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 
614 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.51 
 
 
614 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.51 
 
 
614 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
542 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 
614 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 
486 aa  63.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 
636 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.33 
 
 
586 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 
612 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 
1737 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
288 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 
968 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 
601 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
643 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
685 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 
534 aa  60.1  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
762 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
362 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
502 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 
718 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
605 aa  59.7  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2697  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
268 aa  59.7  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000108911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.73 
 
 
884 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
3172 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  29.22 
 
 
603 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 
520 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  23.66 
 
 
795 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.89 
 
 
626 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.47 
 
 
1694 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
767 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
766 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 
3145 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
789 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 
824 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4485  transcriptional regulator, CadC  29.53 
 
 
520 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0188012  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
620 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.04 
 
 
689 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  24.53 
 
 
979 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 
512 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25 
 
 
887 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
315 aa  57.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.59 
 
 
620 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
377 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  29.48 
 
 
566 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 
638 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  28.95 
 
 
576 aa  57.4  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
637 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4639  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 
311 aa  57  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.39 
 
 
632 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  30.61 
 
 
561 aa  56.6  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
3301 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 
1276 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  25.28 
 
 
638 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2747  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 
248 aa  56.2  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.79 
 
 
875 aa  56.2  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  30.61 
 
 
561 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 
828 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
681 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1005 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
494 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  31.47 
 
 
656 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.18 
 
 
174 aa  55.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
465 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.33 
 
 
465 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
715 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 
566 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
4489 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28 
 
 
878 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  28.23 
 
 
425 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 
1486 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 
828 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 
323 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.91 
 
 
397 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 
279 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  30.47 
 
 
573 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 
466 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 
4079 aa  54.3  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
435 aa  54.3  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 
573 aa  54.3  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  31.33 
 
 
535 aa  54.3  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.56 
 
 
1274 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>